Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF4Q9NR80 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF4Q9NR80 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF4Q9NR80 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF4Q9NR80 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF4Q9NR80 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF4Q9NR80 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF4Q9NR80 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF4Q9NR80 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF4Q9NR80 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF4Q9NR80 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF4Q9NR80 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF4Q9NR80 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF4Q9NR80 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF4Q9NR80 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF4Q9NR80 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF4Q9NR80 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF4Q9NR80 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF4Q9NR80 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF4Q9NR80 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF4Q9NR80 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF4Q9NR80 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF4Q9NR80 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF4Q9NR80 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF4Q9NR80 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF4Q9NR80 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF4Q9NR80 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF4Q9NR80 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF4Q9NR80 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF4Q9NR80 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF4Q9NR80 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF4Q9NR80 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF4Q9NR80 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF4Q9NR80 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF4Q9NR80 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF4Q9NR80 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF4Q9NR80 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF4Q9NR80 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF4Q9NR80 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF4Q9NR80 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF4Q9NR80 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF4Q9NR80 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF4Q9NR80 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF4Q9NR80 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF4Q9NR80 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF4Q9NR80 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF4Q9NR80 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF4Q9NR80 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF4Q9NR80 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF4Q9NR80 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF4Q9NR80 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF4Q9NR80 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF4Q9NR80 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ARHGEF4Q9NR80 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF4Q9NR80 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF4Q9NR80 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF4Q9NR80 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF4Q9NR80 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF4Q9NR80 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF4Q9NR80 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF4Q9NR80 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF4Q9NR80 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF4Q9NR80 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF4Q9NR80 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF4Q9NR80 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF4Q9NR80 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF4Q9NR80 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF4Q9NR80 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF4Q9NR80 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF4Q9NR80 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGEF4Q9NR80 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGEF4Q9NR80 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGEF4Q9NR80 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF4Q9NR80 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF4Q9NR80 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF4Q9NR80 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF4Q9NR80 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF4Q9NR80 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF4Q9NR80 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF4Q9NR80 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF4Q9NR80 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF4Q9NR80 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF4Q9NR80 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF4Q9NR80 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF4Q9NR80 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF4Q9NR80 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF4Q9NR80 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARHGEF4Q9NR80 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF4Q9NR80 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF4Q9NR80 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF4Q9NR80 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF4Q9NR80 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF4Q9NR80 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF4Q9NR80 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF4Q9NR80 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF4Q9NR80 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF4Q9NR80 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF4Q9NR80 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF4Q9NR80 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF4Q9NR80 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms