Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ89

C12orf4, Protein C12orf4, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf4Q9NQ89 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf4Q9NQ89 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf4Q9NQ89 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf4Q9NQ89 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf4Q9NQ89 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf4Q9NQ89 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf4Q9NQ89 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf4Q9NQ89 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf4Q9NQ89 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf4Q9NQ89 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf4Q9NQ89 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf4Q9NQ89 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf4Q9NQ89 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf4Q9NQ89 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf4Q9NQ89 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf4Q9NQ89 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf4Q9NQ89 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf4Q9NQ89 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf4Q9NQ89 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf4Q9NQ89 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf4Q9NQ89 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf4Q9NQ89 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf4Q9NQ89 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf4Q9NQ89 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf4Q9NQ89 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf4Q9NQ89 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf4Q9NQ89 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf4Q9NQ89 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf4Q9NQ89 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf4Q9NQ89 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf4Q9NQ89 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf4Q9NQ89 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C12orf4Q9NQ89 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C12orf4Q9NQ89 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C12orf4Q9NQ89 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C12orf4Q9NQ89 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf4Q9NQ89 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf4Q9NQ89 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf4Q9NQ89 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf4Q9NQ89 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf4Q9NQ89 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf4Q9NQ89 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf4Q9NQ89 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf4Q9NQ89 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf4Q9NQ89 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf4Q9NQ89 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C12orf4Q9NQ89 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C12orf4Q9NQ89 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C12orf4Q9NQ89 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf4Q9NQ89 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf4Q9NQ89 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf4Q9NQ89 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf4Q9NQ89 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C12orf4Q9NQ89 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C12orf4Q9NQ89 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf4Q9NQ89 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf4Q9NQ89 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf4Q9NQ89 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf4Q9NQ89 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf4Q9NQ89 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf4Q9NQ89 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf4Q9NQ89 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf4Q9NQ89 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf4Q9NQ89 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf4Q9NQ89 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf4Q9NQ89 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf4Q9NQ89 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf4Q9NQ89 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf4Q9NQ89 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf4Q9NQ89 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C12orf4Q9NQ89 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf4Q9NQ89 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf4Q9NQ89 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf4Q9NQ89 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf4Q9NQ89 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf4Q9NQ89 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms