Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRPL40Q9NQ50 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MRPL40Q9NQ50 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MRPL40Q9NQ50 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MRPL40Q9NQ50 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MRPL40Q9NQ50 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MRPL40Q9NQ50 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MRPL40Q9NQ50 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRPL40Q9NQ50 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRPL40Q9NQ50 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRPL40Q9NQ50 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MRPL40Q9NQ50 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MRPL40Q9NQ50 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MRPL40Q9NQ50 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MRPL40Q9NQ50 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MRPL40Q9NQ50 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MRPL40Q9NQ50 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MRPL40Q9NQ50 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MRPL40Q9NQ50 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MRPL40Q9NQ50 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MRPL40Q9NQ50 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MRPL40Q9NQ50 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MRPL40Q9NQ50 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRPL40Q9NQ50 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRPL40Q9NQ50 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRPL40Q9NQ50 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRPL40Q9NQ50 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL40Q9NQ50 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL40Q9NQ50 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL40Q9NQ50 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL40Q9NQ50 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL40Q9NQ50 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRPL40Q9NQ50 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRPL40Q9NQ50 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRPL40Q9NQ50 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MRPL40Q9NQ50 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MRPL40Q9NQ50 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MRPL40Q9NQ50 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MRPL40Q9NQ50 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MRPL40Q9NQ50 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MRPL40Q9NQ50 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MRPL40Q9NQ50 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MRPL40Q9NQ50 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRPL40Q9NQ50 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRPL40Q9NQ50 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRPL40Q9NQ50 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MRPL40Q9NQ50 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MRPL40Q9NQ50 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRPL40Q9NQ50 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MRPL40Q9NQ50 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRPL40Q9NQ50 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRPL40Q9NQ50 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRPL40Q9NQ50 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MRPL40Q9NQ50 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRPL40Q9NQ50 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL40Q9NQ50 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL40Q9NQ50 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL40Q9NQ50 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL40Q9NQ50 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRPL40Q9NQ50 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRPL40Q9NQ50 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRPL40Q9NQ50 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRPL40Q9NQ50 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRPL40Q9NQ50 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRPL40Q9NQ50 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MRPL40Q9NQ50 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MRPL40Q9NQ50 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL40Q9NQ50 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRPL40Q9NQ50 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRPL40Q9NQ50 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRPL40Q9NQ50 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRPL40Q9NQ50 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPL40Q9NQ50 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPL40Q9NQ50 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPL40Q9NQ50 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPL40Q9NQ50 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms