Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rabgef1Q9JM13 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rabgef1Q9JM13 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rabgef1Q9JM13 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rabgef1Q9JM13 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rabgef1Q9JM13 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rabgef1Q9JM13 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rabgef1Q9JM13 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rabgef1Q9JM13 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rabgef1Q9JM13 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rabgef1Q9JM13 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rabgef1Q9JM13 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rabgef1Q9JM13 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rabgef1Q9JM13 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rabgef1Q9JM13 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rabgef1Q9JM13 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rabgef1Q9JM13 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rabgef1Q9JM13 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rabgef1Q9JM13 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rabgef1Q9JM13 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rabgef1Q9JM13 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rabgef1Q9JM13 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rabgef1Q9JM13 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rabgef1Q9JM13 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rabgef1Q9JM13 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rabgef1Q9JM13 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rabgef1Q9JM13 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rabgef1Q9JM13 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rabgef1Q9JM13 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rabgef1Q9JM13 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rabgef1Q9JM13 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rabgef1Q9JM13 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rabgef1Q9JM13 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rabgef1Q9JM13 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rabgef1Q9JM13 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rabgef1Q9JM13 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rabgef1Q9JM13 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rabgef1Q9JM13 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rabgef1Q9JM13 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rabgef1Q9JM13 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rabgef1Q9JM13 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rabgef1Q9JM13 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rabgef1Q9JM13 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rabgef1Q9JM13 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rabgef1Q9JM13 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rabgef1Q9JM13 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rabgef1Q9JM13 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rabgef1Q9JM13 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rabgef1Q9JM13 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rabgef1Q9JM13 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rabgef1Q9JM13 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rabgef1Q9JM13 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rabgef1Q9JM13 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rabgef1Q9JM13 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rabgef1Q9JM13 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rabgef1Q9JM13 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rabgef1Q9JM13 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rabgef1Q9JM13 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rabgef1Q9JM13 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rabgef1Q9JM13 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rabgef1Q9JM13 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rabgef1Q9JM13 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rabgef1Q9JM13 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rabgef1Q9JM13 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rabgef1Q9JM13 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rabgef1Q9JM13 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rabgef1Q9JM13 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rabgef1Q9JM13 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rabgef1Q9JM13 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rabgef1Q9JM13 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rabgef1Q9JM13 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rabgef1Q9JM13 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rabgef1Q9JM13 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rabgef1Q9JM13 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rabgef1Q9JM13 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rabgef1Q9JM13 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rabgef1Q9JM13 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rabgef1Q9JM13 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rabgef1Q9JM13 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rabgef1Q9JM13 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rabgef1Q9JM13 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rabgef1Q9JM13 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rabgef1Q9JM13 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rabgef1Q9JM13 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rabgef1Q9JM13 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rabgef1Q9JM13 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rabgef1Q9JM13 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rabgef1Q9JM13 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rabgef1Q9JM13 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rabgef1Q9JM13 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rabgef1Q9JM13 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rabgef1Q9JM13 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rabgef1Q9JM13 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rabgef1Q9JM13 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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