Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hip1rQ9JKY5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hip1rQ9JKY5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hip1rQ9JKY5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hip1rQ9JKY5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hip1rQ9JKY5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hip1rQ9JKY5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hip1rQ9JKY5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Hip1rQ9JKY5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hip1rQ9JKY5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hip1rQ9JKY5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hip1rQ9JKY5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Hip1rQ9JKY5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hip1rQ9JKY5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hip1rQ9JKY5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hip1rQ9JKY5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hip1rQ9JKY5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Hip1rQ9JKY5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hip1rQ9JKY5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hip1rQ9JKY5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hip1rQ9JKY5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hip1rQ9JKY5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Hip1rQ9JKY5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hip1rQ9JKY5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hip1rQ9JKY5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hip1rQ9JKY5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hip1rQ9JKY5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hip1rQ9JKY5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hip1rQ9JKY5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hip1rQ9JKY5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hip1rQ9JKY5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hip1rQ9JKY5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hip1rQ9JKY5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hip1rQ9JKY5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hip1rQ9JKY5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hip1rQ9JKY5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Hip1rQ9JKY5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hip1rQ9JKY5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hip1rQ9JKY5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Hip1rQ9JKY5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hip1rQ9JKY5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hip1rQ9JKY5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hip1rQ9JKY5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hip1rQ9JKY5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hip1rQ9JKY5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hip1rQ9JKY5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hip1rQ9JKY5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hip1rQ9JKY5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hip1rQ9JKY5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hip1rQ9JKY5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hip1rQ9JKY5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Hip1rQ9JKY5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Hip1rQ9JKY5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hip1rQ9JKY5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hip1rQ9JKY5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hip1rQ9JKY5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hip1rQ9JKY5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hip1rQ9JKY5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hip1rQ9JKY5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hip1rQ9JKY5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hip1rQ9JKY5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hip1rQ9JKY5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hip1rQ9JKY5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hip1rQ9JKY5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hip1rQ9JKY5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hip1rQ9JKY5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hip1rQ9JKY5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hip1rQ9JKY5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hip1rQ9JKY5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Hip1rQ9JKY5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hip1rQ9JKY5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hip1rQ9JKY5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hip1rQ9JKY5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hip1rQ9JKY5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hip1rQ9JKY5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hip1rQ9JKY5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hip1rQ9JKY5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hip1rQ9JKY5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hip1rQ9JKY5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hip1rQ9JKY5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hip1rQ9JKY5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Hip1rQ9JKY5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hip1rQ9JKY5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hip1rQ9JKY5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hip1rQ9JKY5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Hip1rQ9JKY5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hip1rQ9JKY5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hip1rQ9JKY5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hip1rQ9JKY5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hip1rQ9JKY5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hip1rQ9JKY5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hip1rQ9JKY5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hip1rQ9JKY5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hip1rQ9JKY5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hip1rQ9JKY5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hip1rQ9JKY5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hip1rQ9JKY5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hip1rQ9JKY5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hip1rQ9JKY5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hip1rQ9JKY5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms