Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pole3Q9JKP7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pole3Q9JKP7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pole3Q9JKP7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pole3Q9JKP7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pole3Q9JKP7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pole3Q9JKP7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pole3Q9JKP7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pole3Q9JKP7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pole3Q9JKP7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pole3Q9JKP7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pole3Q9JKP7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pole3Q9JKP7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pole3Q9JKP7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pole3Q9JKP7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pole3Q9JKP7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pole3Q9JKP7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pole3Q9JKP7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pole3Q9JKP7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pole3Q9JKP7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pole3Q9JKP7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pole3Q9JKP7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pole3Q9JKP7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pole3Q9JKP7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pole3Q9JKP7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pole3Q9JKP7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pole3Q9JKP7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pole3Q9JKP7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pole3Q9JKP7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pole3Q9JKP7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pole3Q9JKP7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pole3Q9JKP7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pole3Q9JKP7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pole3Q9JKP7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pole3Q9JKP7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pole3Q9JKP7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pole3Q9JKP7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pole3Q9JKP7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pole3Q9JKP7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pole3Q9JKP7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pole3Q9JKP7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pole3Q9JKP7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pole3Q9JKP7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pole3Q9JKP7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pole3Q9JKP7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pole3Q9JKP7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pole3Q9JKP7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pole3Q9JKP7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pole3Q9JKP7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pole3Q9JKP7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pole3Q9JKP7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pole3Q9JKP7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pole3Q9JKP7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pole3Q9JKP7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pole3Q9JKP7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pole3Q9JKP7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pole3Q9JKP7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pole3Q9JKP7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pole3Q9JKP7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pole3Q9JKP7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pole3Q9JKP7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pole3Q9JKP7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pole3Q9JKP7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pole3Q9JKP7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pole3Q9JKP7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pole3Q9JKP7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pole3Q9JKP7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pole3Q9JKP7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pole3Q9JKP7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pole3Q9JKP7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pole3Q9JKP7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pole3Q9JKP7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pole3Q9JKP7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pole3Q9JKP7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pole3Q9JKP7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pole3Q9JKP7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pole3Q9JKP7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pole3Q9JKP7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pole3Q9JKP7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pole3Q9JKP7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pole3Q9JKP7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pole3Q9JKP7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pole3Q9JKP7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pole3Q9JKP7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pole3Q9JKP7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pole3Q9JKP7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pole3Q9JKP7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pole3Q9JKP7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pole3Q9JKP7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pole3Q9JKP7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pole3Q9JKP7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pole3Q9JKP7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pole3Q9JKP7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pole3Q9JKP7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pole3Q9JKP7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pole3Q9JKP7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pole3Q9JKP7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pole3Q9JKP7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pole3Q9JKP7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pole3Q9JKP7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms