Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SRA1Q9HD15 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SRA1Q9HD15 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRA1Q9HD15 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SRA1Q9HD15 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRA1Q9HD15 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRA1Q9HD15 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRA1Q9HD15 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRA1Q9HD15 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRA1Q9HD15 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRA1Q9HD15 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRA1Q9HD15 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SRA1Q9HD15 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRA1Q9HD15 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRA1Q9HD15 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SRA1Q9HD15 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRA1Q9HD15 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRA1Q9HD15 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRA1Q9HD15 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRA1Q9HD15 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRA1Q9HD15 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRA1Q9HD15 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRA1Q9HD15 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRA1Q9HD15 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SRA1Q9HD15 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRA1Q9HD15 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRA1Q9HD15 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRA1Q9HD15 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRA1Q9HD15 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRA1Q9HD15 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRA1Q9HD15 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRA1Q9HD15 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRA1Q9HD15 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRA1Q9HD15 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRA1Q9HD15 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRA1Q9HD15 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRA1Q9HD15 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRA1Q9HD15 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRA1Q9HD15 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRA1Q9HD15 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRA1Q9HD15 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRA1Q9HD15 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRA1Q9HD15 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRA1Q9HD15 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRA1Q9HD15 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRA1Q9HD15 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRA1Q9HD15 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRA1Q9HD15 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRA1Q9HD15 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SRA1Q9HD15 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRA1Q9HD15 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRA1Q9HD15 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRA1Q9HD15 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRA1Q9HD15 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRA1Q9HD15 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRA1Q9HD15 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRA1Q9HD15 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRA1Q9HD15 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRA1Q9HD15 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRA1Q9HD15 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRA1Q9HD15 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRA1Q9HD15 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRA1Q9HD15 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRA1Q9HD15 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRA1Q9HD15 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRA1Q9HD15 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRA1Q9HD15 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRA1Q9HD15 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SRA1Q9HD15 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRA1Q9HD15 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRA1Q9HD15 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRA1Q9HD15 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRA1Q9HD15 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRA1Q9HD15 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRA1Q9HD15 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRA1Q9HD15 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRA1Q9HD15 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRA1Q9HD15 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRA1Q9HD15 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRA1Q9HD15 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRA1Q9HD15 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRA1Q9HD15 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRA1Q9HD15 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRA1Q9HD15 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRA1Q9HD15 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRA1Q9HD15 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRA1Q9HD15 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRA1Q9HD15 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRA1Q9HD15 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRA1Q9HD15 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRA1Q9HD15 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRA1Q9HD15 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRA1Q9HD15 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRA1Q9HD15 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRA1Q9HD15 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRA1Q9HD15 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRA1Q9HD15 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRA1Q9HD15 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRA1Q9HD15 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRA1Q9HD15 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms