Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC07

TMEM165, Transmembrane protein 165, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM165Q9HC07 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM165Q9HC07 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM165Q9HC07 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM165Q9HC07 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM165Q9HC07 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM165Q9HC07 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM165Q9HC07 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM165Q9HC07 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM165Q9HC07 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM165Q9HC07 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM165Q9HC07 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM165Q9HC07 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM165Q9HC07 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM165Q9HC07 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM165Q9HC07 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM165Q9HC07 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM165Q9HC07 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM165Q9HC07 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM165Q9HC07 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM165Q9HC07 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM165Q9HC07 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM165Q9HC07 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM165Q9HC07 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM165Q9HC07 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM165Q9HC07 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM165Q9HC07 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM165Q9HC07 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM165Q9HC07 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM165Q9HC07 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM165Q9HC07 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM165Q9HC07 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM165Q9HC07 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM165Q9HC07 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM165Q9HC07 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM165Q9HC07 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM165Q9HC07 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM165Q9HC07 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM165Q9HC07 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM165Q9HC07 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM165Q9HC07 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM165Q9HC07 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM165Q9HC07 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM165Q9HC07 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM165Q9HC07 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM165Q9HC07 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM165Q9HC07 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM165Q9HC07 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM165Q9HC07 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM165Q9HC07 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM165Q9HC07 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM165Q9HC07 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM165Q9HC07 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM165Q9HC07 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM165Q9HC07 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM165Q9HC07 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM165Q9HC07 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM165Q9HC07 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM165Q9HC07 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM165Q9HC07 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM165Q9HC07 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM165Q9HC07 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM165Q9HC07 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM165Q9HC07 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM165Q9HC07 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM165Q9HC07 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM165Q9HC07 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM165Q9HC07 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM165Q9HC07 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM165Q9HC07 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM165Q9HC07 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM165Q9HC07 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM165Q9HC07 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM165Q9HC07 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM165Q9HC07 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM165Q9HC07 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM165Q9HC07 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM165Q9HC07 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM165Q9HC07 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM165Q9HC07 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM165Q9HC07 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM165Q9HC07 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM165Q9HC07 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM165Q9HC07 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM165Q9HC07 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM165Q9HC07 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM165Q9HC07 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM165Q9HC07 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM165Q9HC07 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM165Q9HC07 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM165Q9HC07 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM165Q9HC07 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM165Q9HC07 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM165Q9HC07 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM165Q9HC07 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM165Q9HC07 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM165Q9HC07 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM165Q9HC07 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM165Q9HC07 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM165Q9HC07 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM165Q9HC07 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms