Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBT6

CDH20, Cadherin-20, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH20Q9HBT6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH20Q9HBT6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH20Q9HBT6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH20Q9HBT6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH20Q9HBT6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH20Q9HBT6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH20Q9HBT6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH20Q9HBT6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH20Q9HBT6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH20Q9HBT6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH20Q9HBT6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH20Q9HBT6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH20Q9HBT6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH20Q9HBT6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH20Q9HBT6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH20Q9HBT6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH20Q9HBT6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH20Q9HBT6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH20Q9HBT6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH20Q9HBT6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH20Q9HBT6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH20Q9HBT6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH20Q9HBT6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH20Q9HBT6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH20Q9HBT6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH20Q9HBT6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH20Q9HBT6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH20Q9HBT6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH20Q9HBT6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH20Q9HBT6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH20Q9HBT6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH20Q9HBT6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH20Q9HBT6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH20Q9HBT6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH20Q9HBT6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH20Q9HBT6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH20Q9HBT6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH20Q9HBT6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH20Q9HBT6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH20Q9HBT6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH20Q9HBT6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH20Q9HBT6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH20Q9HBT6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH20Q9HBT6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH20Q9HBT6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH20Q9HBT6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH20Q9HBT6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH20Q9HBT6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH20Q9HBT6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH20Q9HBT6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH20Q9HBT6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH20Q9HBT6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH20Q9HBT6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH20Q9HBT6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH20Q9HBT6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH20Q9HBT6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH20Q9HBT6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH20Q9HBT6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH20Q9HBT6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH20Q9HBT6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH20Q9HBT6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH20Q9HBT6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH20Q9HBT6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH20Q9HBT6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH20Q9HBT6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH20Q9HBT6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH20Q9HBT6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH20Q9HBT6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH20Q9HBT6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH20Q9HBT6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH20Q9HBT6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH20Q9HBT6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH20Q9HBT6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH20Q9HBT6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH20Q9HBT6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH20Q9HBT6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH20Q9HBT6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH20Q9HBT6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH20Q9HBT6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH20Q9HBT6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH20Q9HBT6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH20Q9HBT6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH20Q9HBT6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH20Q9HBT6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH20Q9HBT6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH20Q9HBT6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH20Q9HBT6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH20Q9HBT6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH20Q9HBT6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH20Q9HBT6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH20Q9HBT6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH20Q9HBT6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH20Q9HBT6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH20Q9HBT6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH20Q9HBT6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH20Q9HBT6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH20Q9HBT6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH20Q9HBT6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH20Q9HBT6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH20Q9HBT6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms