Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
CLSPNQ9HAW4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CLSPNQ9HAW4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
CLSPNQ9HAW4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CLSPNQ9HAW4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CLSPNQ9HAW4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CLSPNQ9HAW4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CLSPNQ9HAW4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
CLSPNQ9HAW4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CLSPNQ9HAW4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CLSPNQ9HAW4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CLSPNQ9HAW4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CLSPNQ9HAW4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CLSPNQ9HAW4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
CLSPNQ9HAW4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
CLSPNQ9HAW4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
CLSPNQ9HAW4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CLSPNQ9HAW4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CLSPNQ9HAW4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CLSPNQ9HAW4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CLSPNQ9HAW4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CLSPNQ9HAW4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CLSPNQ9HAW4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CLSPNQ9HAW4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CLSPNQ9HAW4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CLSPNQ9HAW4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CLSPNQ9HAW4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CLSPNQ9HAW4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CLSPNQ9HAW4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
CLSPNQ9HAW4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CLSPNQ9HAW4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CLSPNQ9HAW4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CLSPNQ9HAW4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CLSPNQ9HAW4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CLSPNQ9HAW4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CLSPNQ9HAW4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CLSPNQ9HAW4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CLSPNQ9HAW4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CLSPNQ9HAW4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CLSPNQ9HAW4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CLSPNQ9HAW4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CLSPNQ9HAW4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CLSPNQ9HAW4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CLSPNQ9HAW4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CLSPNQ9HAW4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CLSPNQ9HAW4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CLSPNQ9HAW4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CLSPNQ9HAW4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CLSPNQ9HAW4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CLSPNQ9HAW4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CLSPNQ9HAW4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.82
CLSPNQ9HAW4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CLSPNQ9HAW4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CLSPNQ9HAW4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CLSPNQ9HAW4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CLSPNQ9HAW4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
CLSPNQ9HAW4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CLSPNQ9HAW4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
CLSPNQ9HAW4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CLSPNQ9HAW4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CLSPNQ9HAW4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CLSPNQ9HAW4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
CLSPNQ9HAW4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
CLSPNQ9HAW4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CLSPNQ9HAW4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CLSPNQ9HAW4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CLSPNQ9HAW4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CLSPNQ9HAW4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CLSPNQ9HAW4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CLSPNQ9HAW4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CLSPNQ9HAW4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CLSPNQ9HAW4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CLSPNQ9HAW4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CLSPNQ9HAW4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CLSPNQ9HAW4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
CLSPNQ9HAW4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
CLSPNQ9HAW4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CLSPNQ9HAW4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CLSPNQ9HAW4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CLSPNQ9HAW4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CLSPNQ9HAW4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CLSPNQ9HAW4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CLSPNQ9HAW4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CLSPNQ9HAW4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CLSPNQ9HAW4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CLSPNQ9HAW4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CLSPNQ9HAW4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
CLSPNQ9HAW4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CLSPNQ9HAW4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CLSPNQ9HAW4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CLSPNQ9HAW4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CLSPNQ9HAW4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CLSPNQ9HAW4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CLSPNQ9HAW4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CLSPNQ9HAW4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CLSPNQ9HAW4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CLSPNQ9HAW4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CLSPNQ9HAW4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CLSPNQ9HAW4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CLSPNQ9HAW4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC38.63■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms