Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EBF2Q9HAK2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EBF2Q9HAK2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
EBF2Q9HAK2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EBF2Q9HAK2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EBF2Q9HAK2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EBF2Q9HAK2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EBF2Q9HAK2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EBF2Q9HAK2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
EBF2Q9HAK2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EBF2Q9HAK2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EBF2Q9HAK2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EBF2Q9HAK2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EBF2Q9HAK2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
EBF2Q9HAK2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EBF2Q9HAK2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EBF2Q9HAK2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EBF2Q9HAK2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EBF2Q9HAK2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EBF2Q9HAK2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EBF2Q9HAK2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EBF2Q9HAK2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EBF2Q9HAK2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EBF2Q9HAK2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EBF2Q9HAK2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EBF2Q9HAK2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EBF2Q9HAK2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EBF2Q9HAK2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EBF2Q9HAK2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
EBF2Q9HAK2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EBF2Q9HAK2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EBF2Q9HAK2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EBF2Q9HAK2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EBF2Q9HAK2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EBF2Q9HAK2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EBF2Q9HAK2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EBF2Q9HAK2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
EBF2Q9HAK2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EBF2Q9HAK2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EBF2Q9HAK2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EBF2Q9HAK2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EBF2Q9HAK2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EBF2Q9HAK2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EBF2Q9HAK2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
EBF2Q9HAK2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EBF2Q9HAK2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EBF2Q9HAK2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EBF2Q9HAK2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EBF2Q9HAK2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EBF2Q9HAK2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EBF2Q9HAK2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EBF2Q9HAK2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EBF2Q9HAK2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EBF2Q9HAK2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EBF2Q9HAK2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EBF2Q9HAK2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EBF2Q9HAK2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EBF2Q9HAK2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EBF2Q9HAK2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
EBF2Q9HAK2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EBF2Q9HAK2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EBF2Q9HAK2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EBF2Q9HAK2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EBF2Q9HAK2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EBF2Q9HAK2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EBF2Q9HAK2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EBF2Q9HAK2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EBF2Q9HAK2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EBF2Q9HAK2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EBF2Q9HAK2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EBF2Q9HAK2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EBF2Q9HAK2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EBF2Q9HAK2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EBF2Q9HAK2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EBF2Q9HAK2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EBF2Q9HAK2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EBF2Q9HAK2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EBF2Q9HAK2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EBF2Q9HAK2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EBF2Q9HAK2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EBF2Q9HAK2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EBF2Q9HAK2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EBF2Q9HAK2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EBF2Q9HAK2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EBF2Q9HAK2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EBF2Q9HAK2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EBF2Q9HAK2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EBF2Q9HAK2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EBF2Q9HAK2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EBF2Q9HAK2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EBF2Q9HAK2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EBF2Q9HAK2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EBF2Q9HAK2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EBF2Q9HAK2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EBF2Q9HAK2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EBF2Q9HAK2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EBF2Q9HAK2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EBF2Q9HAK2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EBF2Q9HAK2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EBF2Q9HAK2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms