Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG4Q9H9E3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG4Q9H9E3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG4Q9H9E3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COG4Q9H9E3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COG4Q9H9E3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COG4Q9H9E3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COG4Q9H9E3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG4Q9H9E3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COG4Q9H9E3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COG4Q9H9E3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COG4Q9H9E3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COG4Q9H9E3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG4Q9H9E3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG4Q9H9E3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
COG4Q9H9E3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG4Q9H9E3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG4Q9H9E3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG4Q9H9E3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG4Q9H9E3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG4Q9H9E3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG4Q9H9E3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG4Q9H9E3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG4Q9H9E3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG4Q9H9E3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG4Q9H9E3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG4Q9H9E3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
COG4Q9H9E3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG4Q9H9E3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG4Q9H9E3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG4Q9H9E3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG4Q9H9E3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG4Q9H9E3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG4Q9H9E3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG4Q9H9E3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG4Q9H9E3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COG4Q9H9E3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COG4Q9H9E3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COG4Q9H9E3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COG4Q9H9E3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COG4Q9H9E3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COG4Q9H9E3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COG4Q9H9E3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COG4Q9H9E3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG4Q9H9E3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG4Q9H9E3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG4Q9H9E3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG4Q9H9E3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG4Q9H9E3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG4Q9H9E3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG4Q9H9E3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG4Q9H9E3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG4Q9H9E3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG4Q9H9E3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG4Q9H9E3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG4Q9H9E3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG4Q9H9E3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG4Q9H9E3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG4Q9H9E3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG4Q9H9E3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG4Q9H9E3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COG4Q9H9E3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COG4Q9H9E3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG4Q9H9E3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG4Q9H9E3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG4Q9H9E3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG4Q9H9E3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG4Q9H9E3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COG4Q9H9E3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG4Q9H9E3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG4Q9H9E3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG4Q9H9E3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG4Q9H9E3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG4Q9H9E3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG4Q9H9E3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG4Q9H9E3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG4Q9H9E3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COG4Q9H9E3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COG4Q9H9E3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
COG4Q9H9E3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
COG4Q9H9E3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
COG4Q9H9E3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COG4Q9H9E3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
COG4Q9H9E3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG4Q9H9E3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG4Q9H9E3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG4Q9H9E3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG4Q9H9E3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG4Q9H9E3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG4Q9H9E3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG4Q9H9E3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG4Q9H9E3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG4Q9H9E3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG4Q9H9E3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG4Q9H9E3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
COG4Q9H9E3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG4Q9H9E3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG4Q9H9E3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG4Q9H9E3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG4Q9H9E3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms