Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8S5

CNTD2, Cyclin N-terminal domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD2Q9H8S5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTD2Q9H8S5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNTD2Q9H8S5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTD2Q9H8S5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTD2Q9H8S5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTD2Q9H8S5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTD2Q9H8S5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTD2Q9H8S5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTD2Q9H8S5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTD2Q9H8S5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTD2Q9H8S5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTD2Q9H8S5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTD2Q9H8S5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTD2Q9H8S5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTD2Q9H8S5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTD2Q9H8S5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTD2Q9H8S5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTD2Q9H8S5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTD2Q9H8S5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTD2Q9H8S5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTD2Q9H8S5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTD2Q9H8S5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTD2Q9H8S5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTD2Q9H8S5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTD2Q9H8S5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTD2Q9H8S5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNTD2Q9H8S5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTD2Q9H8S5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTD2Q9H8S5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTD2Q9H8S5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTD2Q9H8S5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTD2Q9H8S5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTD2Q9H8S5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTD2Q9H8S5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTD2Q9H8S5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTD2Q9H8S5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTD2Q9H8S5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTD2Q9H8S5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTD2Q9H8S5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTD2Q9H8S5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTD2Q9H8S5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTD2Q9H8S5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTD2Q9H8S5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTD2Q9H8S5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTD2Q9H8S5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTD2Q9H8S5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTD2Q9H8S5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTD2Q9H8S5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTD2Q9H8S5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTD2Q9H8S5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTD2Q9H8S5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTD2Q9H8S5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTD2Q9H8S5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTD2Q9H8S5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTD2Q9H8S5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTD2Q9H8S5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTD2Q9H8S5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTD2Q9H8S5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTD2Q9H8S5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTD2Q9H8S5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTD2Q9H8S5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTD2Q9H8S5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTD2Q9H8S5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTD2Q9H8S5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTD2Q9H8S5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTD2Q9H8S5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTD2Q9H8S5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTD2Q9H8S5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTD2Q9H8S5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTD2Q9H8S5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTD2Q9H8S5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTD2Q9H8S5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTD2Q9H8S5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTD2Q9H8S5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTD2Q9H8S5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTD2Q9H8S5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTD2Q9H8S5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTD2Q9H8S5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTD2Q9H8S5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTD2Q9H8S5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTD2Q9H8S5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTD2Q9H8S5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTD2Q9H8S5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTD2Q9H8S5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTD2Q9H8S5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTD2Q9H8S5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTD2Q9H8S5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTD2Q9H8S5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTD2Q9H8S5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTD2Q9H8S5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTD2Q9H8S5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTD2Q9H8S5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTD2Q9H8S5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTD2Q9H8S5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTD2Q9H8S5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTD2Q9H8S5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTD2Q9H8S5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTD2Q9H8S5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTD2Q9H8S5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms