Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6E4

CCDC134, Coiled-coil domain-containing protein 134, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC134Q9H6E4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC134Q9H6E4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC134Q9H6E4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC134Q9H6E4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC134Q9H6E4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC134Q9H6E4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC134Q9H6E4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC134Q9H6E4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC134Q9H6E4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC134Q9H6E4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC134Q9H6E4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC134Q9H6E4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC134Q9H6E4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC134Q9H6E4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC134Q9H6E4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC134Q9H6E4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC134Q9H6E4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC134Q9H6E4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC134Q9H6E4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC134Q9H6E4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC134Q9H6E4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC134Q9H6E4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC134Q9H6E4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC134Q9H6E4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC134Q9H6E4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC134Q9H6E4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC134Q9H6E4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC134Q9H6E4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC134Q9H6E4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC134Q9H6E4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC134Q9H6E4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC134Q9H6E4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC134Q9H6E4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC134Q9H6E4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC134Q9H6E4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC134Q9H6E4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC134Q9H6E4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC134Q9H6E4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC134Q9H6E4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC134Q9H6E4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC134Q9H6E4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC134Q9H6E4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC134Q9H6E4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC134Q9H6E4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC134Q9H6E4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC134Q9H6E4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC134Q9H6E4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC134Q9H6E4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC134Q9H6E4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC134Q9H6E4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC134Q9H6E4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC134Q9H6E4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC134Q9H6E4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC134Q9H6E4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC134Q9H6E4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC134Q9H6E4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC134Q9H6E4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC134Q9H6E4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC134Q9H6E4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC134Q9H6E4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC134Q9H6E4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC134Q9H6E4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC134Q9H6E4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC134Q9H6E4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC134Q9H6E4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC134Q9H6E4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC134Q9H6E4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC134Q9H6E4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC134Q9H6E4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC134Q9H6E4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC134Q9H6E4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC134Q9H6E4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC134Q9H6E4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC134Q9H6E4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC134Q9H6E4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC134Q9H6E4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC134Q9H6E4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC134Q9H6E4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC134Q9H6E4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC134Q9H6E4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC134Q9H6E4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC134Q9H6E4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC134Q9H6E4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC134Q9H6E4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC134Q9H6E4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC134Q9H6E4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC134Q9H6E4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC134Q9H6E4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC134Q9H6E4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC134Q9H6E4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC134Q9H6E4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC134Q9H6E4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC134Q9H6E4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC134Q9H6E4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC134Q9H6E4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC134Q9H6E4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC134Q9H6E4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC134Q9H6E4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC134Q9H6E4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC134Q9H6E4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms