Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5V8

CDCP1, CUB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCP1Q9H5V8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms