Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5F2

C11orf1, UPF0686 protein C11orf1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf1Q9H5F2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf1Q9H5F2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf1Q9H5F2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf1Q9H5F2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf1Q9H5F2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf1Q9H5F2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf1Q9H5F2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf1Q9H5F2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf1Q9H5F2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf1Q9H5F2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf1Q9H5F2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C11orf1Q9H5F2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C11orf1Q9H5F2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C11orf1Q9H5F2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C11orf1Q9H5F2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
C11orf1Q9H5F2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf1Q9H5F2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf1Q9H5F2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C11orf1Q9H5F2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C11orf1Q9H5F2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf1Q9H5F2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf1Q9H5F2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf1Q9H5F2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf1Q9H5F2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C11orf1Q9H5F2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C11orf1Q9H5F2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C11orf1Q9H5F2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf1Q9H5F2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf1Q9H5F2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf1Q9H5F2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf1Q9H5F2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf1Q9H5F2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf1Q9H5F2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf1Q9H5F2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf1Q9H5F2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf1Q9H5F2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf1Q9H5F2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf1Q9H5F2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf1Q9H5F2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf1Q9H5F2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf1Q9H5F2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf1Q9H5F2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf1Q9H5F2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf1Q9H5F2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf1Q9H5F2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf1Q9H5F2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf1Q9H5F2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf1Q9H5F2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf1Q9H5F2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf1Q9H5F2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf1Q9H5F2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf1Q9H5F2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf1Q9H5F2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf1Q9H5F2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf1Q9H5F2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf1Q9H5F2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf1Q9H5F2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf1Q9H5F2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf1Q9H5F2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf1Q9H5F2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf1Q9H5F2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf1Q9H5F2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf1Q9H5F2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf1Q9H5F2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf1Q9H5F2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf1Q9H5F2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf1Q9H5F2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf1Q9H5F2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf1Q9H5F2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf1Q9H5F2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf1Q9H5F2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf1Q9H5F2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf1Q9H5F2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf1Q9H5F2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf1Q9H5F2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C11orf1Q9H5F2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
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