Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PARLQ9H300 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PARLQ9H300 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PARLQ9H300 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PARLQ9H300 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PARLQ9H300 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PARLQ9H300 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PARLQ9H300 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PARLQ9H300 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARLQ9H300 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms