Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SIL1Q9H173 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SIL1Q9H173 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SIL1Q9H173 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SIL1Q9H173 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SIL1Q9H173 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SIL1Q9H173 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SIL1Q9H173 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SIL1Q9H173 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SIL1Q9H173 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
SIL1Q9H173 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SIL1Q9H173 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SIL1Q9H173 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SIL1Q9H173 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SIL1Q9H173 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SIL1Q9H173 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SIL1Q9H173 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SIL1Q9H173 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SIL1Q9H173 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SIL1Q9H173 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SIL1Q9H173 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SIL1Q9H173 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SIL1Q9H173 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SIL1Q9H173 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SIL1Q9H173 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SIL1Q9H173 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SIL1Q9H173 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SIL1Q9H173 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SIL1Q9H173 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SIL1Q9H173 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SIL1Q9H173 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SIL1Q9H173 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SIL1Q9H173 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SIL1Q9H173 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SIL1Q9H173 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
SIL1Q9H173 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SIL1Q9H173 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SIL1Q9H173 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SIL1Q9H173 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SIL1Q9H173 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SIL1Q9H173 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
SIL1Q9H173 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SIL1Q9H173 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SIL1Q9H173 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SIL1Q9H173 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SIL1Q9H173 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SIL1Q9H173 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SIL1Q9H173 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SIL1Q9H173 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SIL1Q9H173 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SIL1Q9H173 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SIL1Q9H173 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SIL1Q9H173 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SIL1Q9H173 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SIL1Q9H173 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SIL1Q9H173 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SIL1Q9H173 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SIL1Q9H173 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SIL1Q9H173 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SIL1Q9H173 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SIL1Q9H173 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SIL1Q9H173 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SIL1Q9H173 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SIL1Q9H173 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SIL1Q9H173 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SIL1Q9H173 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SIL1Q9H173 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SIL1Q9H173 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SIL1Q9H173 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SIL1Q9H173 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SIL1Q9H173 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SIL1Q9H173 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SIL1Q9H173 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SIL1Q9H173 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SIL1Q9H173 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SIL1Q9H173 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SIL1Q9H173 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SIL1Q9H173 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SIL1Q9H173 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SIL1Q9H173 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SIL1Q9H173 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
SIL1Q9H173 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SIL1Q9H173 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SIL1Q9H173 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SIL1Q9H173 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SIL1Q9H173 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SIL1Q9H173 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SIL1Q9H173 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SIL1Q9H173 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SIL1Q9H173 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SIL1Q9H173 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SIL1Q9H173 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SIL1Q9H173 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SIL1Q9H173 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
SIL1Q9H173 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SIL1Q9H173 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SIL1Q9H173 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SIL1Q9H173 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SIL1Q9H173 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SIL1Q9H173 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms