Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH19Q9H159 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH19Q9H159 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH19Q9H159 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDH19Q9H159 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH19Q9H159 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH19Q9H159 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH19Q9H159 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH19Q9H159 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH19Q9H159 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH19Q9H159 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH19Q9H159 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH19Q9H159 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH19Q9H159 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH19Q9H159 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH19Q9H159 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH19Q9H159 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDH19Q9H159 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CDH19Q9H159 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH19Q9H159 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH19Q9H159 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDH19Q9H159 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDH19Q9H159 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDH19Q9H159 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CDH19Q9H159 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDH19Q9H159 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH19Q9H159 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH19Q9H159 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH19Q9H159 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH19Q9H159 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH19Q9H159 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH19Q9H159 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH19Q9H159 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH19Q9H159 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH19Q9H159 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH19Q9H159 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH19Q9H159 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH19Q9H159 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH19Q9H159 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH19Q9H159 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH19Q9H159 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH19Q9H159 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH19Q9H159 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH19Q9H159 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH19Q9H159 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH19Q9H159 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDH19Q9H159 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDH19Q9H159 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CDH19Q9H159 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH19Q9H159 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH19Q9H159 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH19Q9H159 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH19Q9H159 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH19Q9H159 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH19Q9H159 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH19Q9H159 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH19Q9H159 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH19Q9H159 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH19Q9H159 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH19Q9H159 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH19Q9H159 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH19Q9H159 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH19Q9H159 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDH19Q9H159 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH19Q9H159 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH19Q9H159 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH19Q9H159 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH19Q9H159 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH19Q9H159 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH19Q9H159 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH19Q9H159 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDH19Q9H159 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CDH19Q9H159 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDH19Q9H159 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDH19Q9H159 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDH19Q9H159 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDH19Q9H159 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms