Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM8

NDEL1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDEL1Q9GZM8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDEL1Q9GZM8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDEL1Q9GZM8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDEL1Q9GZM8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDEL1Q9GZM8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDEL1Q9GZM8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NDEL1Q9GZM8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NDEL1Q9GZM8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDEL1Q9GZM8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDEL1Q9GZM8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDEL1Q9GZM8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDEL1Q9GZM8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDEL1Q9GZM8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDEL1Q9GZM8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDEL1Q9GZM8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDEL1Q9GZM8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDEL1Q9GZM8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDEL1Q9GZM8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDEL1Q9GZM8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDEL1Q9GZM8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDEL1Q9GZM8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDEL1Q9GZM8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDEL1Q9GZM8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDEL1Q9GZM8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDEL1Q9GZM8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDEL1Q9GZM8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDEL1Q9GZM8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDEL1Q9GZM8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDEL1Q9GZM8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDEL1Q9GZM8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDEL1Q9GZM8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDEL1Q9GZM8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDEL1Q9GZM8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDEL1Q9GZM8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NDEL1Q9GZM8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDEL1Q9GZM8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDEL1Q9GZM8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDEL1Q9GZM8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDEL1Q9GZM8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDEL1Q9GZM8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDEL1Q9GZM8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDEL1Q9GZM8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDEL1Q9GZM8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDEL1Q9GZM8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDEL1Q9GZM8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDEL1Q9GZM8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDEL1Q9GZM8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDEL1Q9GZM8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDEL1Q9GZM8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDEL1Q9GZM8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDEL1Q9GZM8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDEL1Q9GZM8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDEL1Q9GZM8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDEL1Q9GZM8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NDEL1Q9GZM8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDEL1Q9GZM8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDEL1Q9GZM8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDEL1Q9GZM8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDEL1Q9GZM8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDEL1Q9GZM8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDEL1Q9GZM8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDEL1Q9GZM8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDEL1Q9GZM8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NDEL1Q9GZM8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDEL1Q9GZM8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NDEL1Q9GZM8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDEL1Q9GZM8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDEL1Q9GZM8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDEL1Q9GZM8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDEL1Q9GZM8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDEL1Q9GZM8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDEL1Q9GZM8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NDEL1Q9GZM8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDEL1Q9GZM8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDEL1Q9GZM8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDEL1Q9GZM8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDEL1Q9GZM8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDEL1Q9GZM8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDEL1Q9GZM8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDEL1Q9GZM8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDEL1Q9GZM8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDEL1Q9GZM8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NDEL1Q9GZM8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NDEL1Q9GZM8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDEL1Q9GZM8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDEL1Q9GZM8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDEL1Q9GZM8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDEL1Q9GZM8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDEL1Q9GZM8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDEL1Q9GZM8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDEL1Q9GZM8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NDEL1Q9GZM8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NDEL1Q9GZM8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDEL1Q9GZM8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDEL1Q9GZM8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDEL1Q9GZM8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDEL1Q9GZM8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDEL1Q9GZM8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDEL1Q9GZM8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDEL1Q9GZM8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms