Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cldn19Q9ET38 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cldn19Q9ET38 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cldn19Q9ET38 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cldn19Q9ET38 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cldn19Q9ET38 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cldn19Q9ET38 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cldn19Q9ET38 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cldn19Q9ET38 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cldn19Q9ET38 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cldn19Q9ET38 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cldn19Q9ET38 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cldn19Q9ET38 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cldn19Q9ET38 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cldn19Q9ET38 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cldn19Q9ET38 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cldn19Q9ET38 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cldn19Q9ET38 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cldn19Q9ET38 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Cldn19Q9ET38 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cldn19Q9ET38 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cldn19Q9ET38 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cldn19Q9ET38 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cldn19Q9ET38 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cldn19Q9ET38 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cldn19Q9ET38 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cldn19Q9ET38 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cldn19Q9ET38 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cldn19Q9ET38 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cldn19Q9ET38 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cldn19Q9ET38 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cldn19Q9ET38 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cldn19Q9ET38 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cldn19Q9ET38 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cldn19Q9ET38 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cldn19Q9ET38 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cldn19Q9ET38 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cldn19Q9ET38 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cldn19Q9ET38 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cldn19Q9ET38 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cldn19Q9ET38 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cldn19Q9ET38 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cldn19Q9ET38 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cldn19Q9ET38 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cldn19Q9ET38 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cldn19Q9ET38 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cldn19Q9ET38 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cldn19Q9ET38 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cldn19Q9ET38 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cldn19Q9ET38 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cldn19Q9ET38 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cldn19Q9ET38 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cldn19Q9ET38 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cldn19Q9ET38 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cldn19Q9ET38 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cldn19Q9ET38 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cldn19Q9ET38 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cldn19Q9ET38 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cldn19Q9ET38 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cldn19Q9ET38 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cldn19Q9ET38 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cldn19Q9ET38 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cldn19Q9ET38 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cldn19Q9ET38 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cldn19Q9ET38 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cldn19Q9ET38 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cldn19Q9ET38 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cldn19Q9ET38 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cldn19Q9ET38 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cldn19Q9ET38 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cldn19Q9ET38 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cldn19Q9ET38 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cldn19Q9ET38 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cldn19Q9ET38 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cldn19Q9ET38 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cldn19Q9ET38 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cldn19Q9ET38 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cldn19Q9ET38 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cldn19Q9ET38 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cldn19Q9ET38 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cldn19Q9ET38 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cldn19Q9ET38 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cldn19Q9ET38 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cldn19Q9ET38 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cldn19Q9ET38 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cldn19Q9ET38 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cldn19Q9ET38 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cldn19Q9ET38 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cldn19Q9ET38 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cldn19Q9ET38 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cldn19Q9ET38 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cldn19Q9ET38 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cldn19Q9ET38 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cldn19Q9ET38 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cldn19Q9ET38 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cldn19Q9ET38 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cldn19Q9ET38 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cldn19Q9ET38 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cldn19Q9ET38 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cldn19Q9ET38 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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