Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pgpep1Q9ESW8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pgpep1Q9ESW8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pgpep1Q9ESW8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pgpep1Q9ESW8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pgpep1Q9ESW8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pgpep1Q9ESW8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pgpep1Q9ESW8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pgpep1Q9ESW8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pgpep1Q9ESW8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pgpep1Q9ESW8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pgpep1Q9ESW8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pgpep1Q9ESW8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pgpep1Q9ESW8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pgpep1Q9ESW8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pgpep1Q9ESW8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pgpep1Q9ESW8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pgpep1Q9ESW8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pgpep1Q9ESW8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pgpep1Q9ESW8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pgpep1Q9ESW8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pgpep1Q9ESW8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pgpep1Q9ESW8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pgpep1Q9ESW8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pgpep1Q9ESW8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pgpep1Q9ESW8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pgpep1Q9ESW8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pgpep1Q9ESW8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pgpep1Q9ESW8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pgpep1Q9ESW8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pgpep1Q9ESW8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pgpep1Q9ESW8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pgpep1Q9ESW8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pgpep1Q9ESW8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pgpep1Q9ESW8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pgpep1Q9ESW8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pgpep1Q9ESW8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pgpep1Q9ESW8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pgpep1Q9ESW8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pgpep1Q9ESW8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pgpep1Q9ESW8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pgpep1Q9ESW8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pgpep1Q9ESW8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pgpep1Q9ESW8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pgpep1Q9ESW8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pgpep1Q9ESW8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pgpep1Q9ESW8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pgpep1Q9ESW8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pgpep1Q9ESW8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pgpep1Q9ESW8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pgpep1Q9ESW8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pgpep1Q9ESW8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pgpep1Q9ESW8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pgpep1Q9ESW8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pgpep1Q9ESW8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pgpep1Q9ESW8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pgpep1Q9ESW8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pgpep1Q9ESW8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pgpep1Q9ESW8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pgpep1Q9ESW8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pgpep1Q9ESW8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pgpep1Q9ESW8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pgpep1Q9ESW8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pgpep1Q9ESW8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pgpep1Q9ESW8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pgpep1Q9ESW8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pgpep1Q9ESW8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Pgpep1Q9ESW8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pgpep1Q9ESW8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pgpep1Q9ESW8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pgpep1Q9ESW8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Pgpep1Q9ESW8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pgpep1Q9ESW8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pgpep1Q9ESW8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pgpep1Q9ESW8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pgpep1Q9ESW8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pgpep1Q9ESW8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pgpep1Q9ESW8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pgpep1Q9ESW8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pgpep1Q9ESW8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pgpep1Q9ESW8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pgpep1Q9ESW8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pgpep1Q9ESW8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pgpep1Q9ESW8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pgpep1Q9ESW8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pgpep1Q9ESW8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pgpep1Q9ESW8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pgpep1Q9ESW8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pgpep1Q9ESW8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pgpep1Q9ESW8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pgpep1Q9ESW8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pgpep1Q9ESW8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pgpep1Q9ESW8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pgpep1Q9ESW8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pgpep1Q9ESW8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms