Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM6

Gdpd2, Glycerophosphoinositol inositolphosphodiesterase GDPD2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd2Q9ESM6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gdpd2Q9ESM6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gdpd2Q9ESM6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gdpd2Q9ESM6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gdpd2Q9ESM6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gdpd2Q9ESM6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gdpd2Q9ESM6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Gdpd2Q9ESM6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gdpd2Q9ESM6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gdpd2Q9ESM6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gdpd2Q9ESM6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gdpd2Q9ESM6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gdpd2Q9ESM6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gdpd2Q9ESM6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gdpd2Q9ESM6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gdpd2Q9ESM6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gdpd2Q9ESM6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gdpd2Q9ESM6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gdpd2Q9ESM6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gdpd2Q9ESM6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gdpd2Q9ESM6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gdpd2Q9ESM6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Gdpd2Q9ESM6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gdpd2Q9ESM6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gdpd2Q9ESM6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gdpd2Q9ESM6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gdpd2Q9ESM6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gdpd2Q9ESM6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gdpd2Q9ESM6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gdpd2Q9ESM6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gdpd2Q9ESM6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gdpd2Q9ESM6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gdpd2Q9ESM6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gdpd2Q9ESM6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Gdpd2Q9ESM6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Gdpd2Q9ESM6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Gdpd2Q9ESM6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gdpd2Q9ESM6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gdpd2Q9ESM6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Gdpd2Q9ESM6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gdpd2Q9ESM6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gdpd2Q9ESM6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gdpd2Q9ESM6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gdpd2Q9ESM6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gdpd2Q9ESM6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gdpd2Q9ESM6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gdpd2Q9ESM6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gdpd2Q9ESM6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gdpd2Q9ESM6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gdpd2Q9ESM6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gdpd2Q9ESM6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Gdpd2Q9ESM6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gdpd2Q9ESM6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gdpd2Q9ESM6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gdpd2Q9ESM6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gdpd2Q9ESM6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gdpd2Q9ESM6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gdpd2Q9ESM6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gdpd2Q9ESM6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gdpd2Q9ESM6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gdpd2Q9ESM6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gdpd2Q9ESM6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gdpd2Q9ESM6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gdpd2Q9ESM6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gdpd2Q9ESM6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gdpd2Q9ESM6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gdpd2Q9ESM6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gdpd2Q9ESM6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gdpd2Q9ESM6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gdpd2Q9ESM6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gdpd2Q9ESM6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gdpd2Q9ESM6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gdpd2Q9ESM6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gdpd2Q9ESM6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gdpd2Q9ESM6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gdpd2Q9ESM6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gdpd2Q9ESM6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gdpd2Q9ESM6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gdpd2Q9ESM6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gdpd2Q9ESM6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gdpd2Q9ESM6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gdpd2Q9ESM6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gdpd2Q9ESM6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gdpd2Q9ESM6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gdpd2Q9ESM6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gdpd2Q9ESM6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gdpd2Q9ESM6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gdpd2Q9ESM6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gdpd2Q9ESM6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gdpd2Q9ESM6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gdpd2Q9ESM6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gdpd2Q9ESM6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gdpd2Q9ESM6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gdpd2Q9ESM6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gdpd2Q9ESM6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gdpd2Q9ESM6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gdpd2Q9ESM6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gdpd2Q9ESM6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gdpd2Q9ESM6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gdpd2Q9ESM6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms