Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC47.56■■■■■ 5.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC47.56■■■■■ 5.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC47.55■■■■■ 5.2
Rb1cc1Q9ESK9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
Rb1cc1Q9ESK9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
Rb1cc1Q9ESK9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47.5■■■■■ 5.2
Rb1cc1Q9ESK9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
Rb1cc1Q9ESK9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
Rb1cc1Q9ESK9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
Rb1cc1Q9ESK9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC47.49■■■■■ 5.19
Rb1cc1Q9ESK9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
Rb1cc1Q9ESK9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
Rb1cc1Q9ESK9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.48■■■■■ 5.19
Rb1cc1Q9ESK9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC47.47■■■■■ 5.19
Rb1cc1Q9ESK9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
Rb1cc1Q9ESK9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
Rb1cc1Q9ESK9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.45■■■■■ 5.19
Rb1cc1Q9ESK9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC47.45■■■■■ 5.19
Rb1cc1Q9ESK9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.19
Rb1cc1Q9ESK9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.42■■■■■ 5.18
Rb1cc1Q9ESK9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.37■■■■■ 5.17
Rb1cc1Q9ESK9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
Rb1cc1Q9ESK9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
Rb1cc1Q9ESK9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
Rb1cc1Q9ESK9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
Rb1cc1Q9ESK9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
Rb1cc1Q9ESK9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
Rb1cc1Q9ESK9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
Rb1cc1Q9ESK9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
Rb1cc1Q9ESK9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
Rb1cc1Q9ESK9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
Rb1cc1Q9ESK9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC47.22■■■■■ 5.15
Rb1cc1Q9ESK9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.21■■■■■ 5.15
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC47.11■■■■■ 5.13
Rb1cc1Q9ESK9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.11■■■■■ 5.13
Rb1cc1Q9ESK9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC47.07■■■■■ 5.13
Rb1cc1Q9ESK9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
Rb1cc1Q9ESK9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
Rb1cc1Q9ESK9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
Rb1cc1Q9ESK9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
Rb1cc1Q9ESK9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
Rb1cc1Q9ESK9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC46.99■■■■■ 5.11
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
Rb1cc1Q9ESK9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
Rb1cc1Q9ESK9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
Rb1cc1Q9ESK9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
Rb1cc1Q9ESK9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
Rb1cc1Q9ESK9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC46.96■■■■■ 5.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC46.96■■■■■ 5.11
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC46.95■■■■■ 5.11
Rb1cc1Q9ESK9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC46.95■■■■■ 5.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC46.94■■■■■ 5.11
Rb1cc1Q9ESK9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
Rb1cc1Q9ESK9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
Rb1cc1Q9ESK9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC46.91■■■■■ 5.1
Rb1cc1Q9ESK9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
Rb1cc1Q9ESK9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC46.84■■■■■ 5.09
Rb1cc1Q9ESK9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
Rb1cc1Q9ESK9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC46.81■■■■■ 5.08
Rb1cc1Q9ESK9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC46.81■■■■■ 5.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC46.81■■■■■ 5.08
Rb1cc1Q9ESK9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
Rb1cc1Q9ESK9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
Rb1cc1Q9ESK9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
Rb1cc1Q9ESK9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
Rb1cc1Q9ESK9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC46.75■■■■■ 5.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC46.73■■■■■ 5.07
Rb1cc1Q9ESK9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC46.73■■■■■ 5.07
Rb1cc1Q9ESK9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
Rb1cc1Q9ESK9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
Rb1cc1Q9ESK9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
Rb1cc1Q9ESK9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
Rb1cc1Q9ESK9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
Rb1cc1Q9ESK9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC46.7■■■■■ 5.07
Rb1cc1Q9ESK9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
Rb1cc1Q9ESK9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC46.7■■■■■ 5.07
Rb1cc1Q9ESK9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC46.69■■■■■ 5.06
Rb1cc1Q9ESK9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC46.68■■■■■ 5.06
Rb1cc1Q9ESK9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC46.68■■■■■ 5.06
Rb1cc1Q9ESK9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
Rb1cc1Q9ESK9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC46.64■■■■■ 5.06
Rb1cc1Q9ESK9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
Rb1cc1Q9ESK9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC46.58■■■■■ 5.05
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
Rb1cc1Q9ESK9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC46.55■■■■■ 5.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC46.55■■■■■ 5.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms