Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx12Q9ER00 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx12Q9ER00 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stx12Q9ER00 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx12Q9ER00 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx12Q9ER00 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx12Q9ER00 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx12Q9ER00 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx12Q9ER00 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx12Q9ER00 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx12Q9ER00 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx12Q9ER00 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx12Q9ER00 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx12Q9ER00 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx12Q9ER00 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx12Q9ER00 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx12Q9ER00 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx12Q9ER00 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx12Q9ER00 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx12Q9ER00 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx12Q9ER00 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx12Q9ER00 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx12Q9ER00 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx12Q9ER00 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx12Q9ER00 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx12Q9ER00 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx12Q9ER00 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx12Q9ER00 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx12Q9ER00 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx12Q9ER00 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx12Q9ER00 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx12Q9ER00 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx12Q9ER00 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx12Q9ER00 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx12Q9ER00 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx12Q9ER00 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx12Q9ER00 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx12Q9ER00 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx12Q9ER00 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx12Q9ER00 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx12Q9ER00 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx12Q9ER00 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx12Q9ER00 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx12Q9ER00 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx12Q9ER00 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx12Q9ER00 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx12Q9ER00 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx12Q9ER00 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx12Q9ER00 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx12Q9ER00 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx12Q9ER00 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx12Q9ER00 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx12Q9ER00 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx12Q9ER00 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx12Q9ER00 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx12Q9ER00 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx12Q9ER00 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx12Q9ER00 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx12Q9ER00 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx12Q9ER00 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx12Q9ER00 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stx12Q9ER00 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stx12Q9ER00 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Stx12Q9ER00 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx12Q9ER00 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx12Q9ER00 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx12Q9ER00 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx12Q9ER00 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx12Q9ER00 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx12Q9ER00 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx12Q9ER00 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx12Q9ER00 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx12Q9ER00 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx12Q9ER00 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx12Q9ER00 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx12Q9ER00 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx12Q9ER00 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx12Q9ER00 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx12Q9ER00 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx12Q9ER00 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx12Q9ER00 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx12Q9ER00 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx12Q9ER00 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stx12Q9ER00 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx12Q9ER00 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx12Q9ER00 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx12Q9ER00 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx12Q9ER00 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx12Q9ER00 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx12Q9ER00 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx12Q9ER00 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx12Q9ER00 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx12Q9ER00 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx12Q9ER00 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx12Q9ER00 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx12Q9ER00 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx12Q9ER00 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx12Q9ER00 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx12Q9ER00 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx12Q9ER00 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms