Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Col4a3bpQ9EQG9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col4a3bpQ9EQG9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col4a3bpQ9EQG9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col4a3bpQ9EQG9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col4a3bpQ9EQG9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col4a3bpQ9EQG9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Col4a3bpQ9EQG9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Col4a3bpQ9EQG9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Col4a3bpQ9EQG9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Col4a3bpQ9EQG9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Col4a3bpQ9EQG9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Col4a3bpQ9EQG9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Col4a3bpQ9EQG9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Col4a3bpQ9EQG9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Col4a3bpQ9EQG9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Col4a3bpQ9EQG9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Col4a3bpQ9EQG9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Col4a3bpQ9EQG9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Col4a3bpQ9EQG9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Col4a3bpQ9EQG9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Col4a3bpQ9EQG9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Col4a3bpQ9EQG9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Col4a3bpQ9EQG9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Col4a3bpQ9EQG9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col4a3bpQ9EQG9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col4a3bpQ9EQG9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col4a3bpQ9EQG9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col4a3bpQ9EQG9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Col4a3bpQ9EQG9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Col4a3bpQ9EQG9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Col4a3bpQ9EQG9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Col4a3bpQ9EQG9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Col4a3bpQ9EQG9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Col4a3bpQ9EQG9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Col4a3bpQ9EQG9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Col4a3bpQ9EQG9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Col4a3bpQ9EQG9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Col4a3bpQ9EQG9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Col4a3bpQ9EQG9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Col4a3bpQ9EQG9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Col4a3bpQ9EQG9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col4a3bpQ9EQG9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col4a3bpQ9EQG9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col4a3bpQ9EQG9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col4a3bpQ9EQG9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Col4a3bpQ9EQG9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Col4a3bpQ9EQG9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Col4a3bpQ9EQG9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Col4a3bpQ9EQG9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Col4a3bpQ9EQG9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Col4a3bpQ9EQG9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Col4a3bpQ9EQG9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Col4a3bpQ9EQG9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Col4a3bpQ9EQG9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col4a3bpQ9EQG9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Col4a3bpQ9EQG9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col4a3bpQ9EQG9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col4a3bpQ9EQG9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col4a3bpQ9EQG9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col4a3bpQ9EQG9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Col4a3bpQ9EQG9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col4a3bpQ9EQG9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col4a3bpQ9EQG9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col4a3bpQ9EQG9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col4a3bpQ9EQG9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col4a3bpQ9EQG9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col4a3bpQ9EQG9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col4a3bpQ9EQG9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col4a3bpQ9EQG9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col4a3bpQ9EQG9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col4a3bpQ9EQG9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col4a3bpQ9EQG9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col4a3bpQ9EQG9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col4a3bpQ9EQG9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col4a3bpQ9EQG9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col4a3bpQ9EQG9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col4a3bpQ9EQG9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col4a3bpQ9EQG9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col4a3bpQ9EQG9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col4a3bpQ9EQG9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col4a3bpQ9EQG9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col4a3bpQ9EQG9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Col4a3bpQ9EQG9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Col4a3bpQ9EQG9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col4a3bpQ9EQG9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Col4a3bpQ9EQG9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col4a3bpQ9EQG9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col4a3bpQ9EQG9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col4a3bpQ9EQG9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Col4a3bpQ9EQG9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col4a3bpQ9EQG9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Col4a3bpQ9EQG9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Col4a3bpQ9EQG9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col4a3bpQ9EQG9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms