Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Riok3Q9DBU3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Riok3Q9DBU3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Riok3Q9DBU3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Riok3Q9DBU3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Riok3Q9DBU3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Riok3Q9DBU3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Riok3Q9DBU3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Riok3Q9DBU3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Riok3Q9DBU3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Riok3Q9DBU3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Riok3Q9DBU3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Riok3Q9DBU3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Riok3Q9DBU3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Riok3Q9DBU3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Riok3Q9DBU3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Riok3Q9DBU3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Riok3Q9DBU3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Riok3Q9DBU3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Riok3Q9DBU3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Riok3Q9DBU3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Riok3Q9DBU3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Riok3Q9DBU3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Riok3Q9DBU3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Riok3Q9DBU3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Riok3Q9DBU3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Riok3Q9DBU3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Riok3Q9DBU3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Riok3Q9DBU3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Riok3Q9DBU3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Riok3Q9DBU3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Riok3Q9DBU3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Riok3Q9DBU3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Riok3Q9DBU3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Riok3Q9DBU3 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Riok3Q9DBU3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Riok3Q9DBU3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Riok3Q9DBU3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Riok3Q9DBU3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Riok3Q9DBU3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Riok3Q9DBU3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Riok3Q9DBU3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Riok3Q9DBU3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Riok3Q9DBU3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Riok3Q9DBU3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Riok3Q9DBU3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Riok3Q9DBU3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Riok3Q9DBU3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Riok3Q9DBU3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Riok3Q9DBU3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Riok3Q9DBU3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Riok3Q9DBU3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Riok3Q9DBU3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Riok3Q9DBU3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Riok3Q9DBU3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Riok3Q9DBU3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Riok3Q9DBU3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Riok3Q9DBU3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Riok3Q9DBU3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Riok3Q9DBU3 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Riok3Q9DBU3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Riok3Q9DBU3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Riok3Q9DBU3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Riok3Q9DBU3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Riok3Q9DBU3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Riok3Q9DBU3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Riok3Q9DBU3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Riok3Q9DBU3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Riok3Q9DBU3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Riok3Q9DBU3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Riok3Q9DBU3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Riok3Q9DBU3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Riok3Q9DBU3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Riok3Q9DBU3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Riok3Q9DBU3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Riok3Q9DBU3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Riok3Q9DBU3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Riok3Q9DBU3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Riok3Q9DBU3 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Riok3Q9DBU3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Riok3Q9DBU3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Riok3Q9DBU3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Riok3Q9DBU3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Riok3Q9DBU3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Riok3Q9DBU3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Riok3Q9DBU3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Riok3Q9DBU3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Riok3Q9DBU3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Riok3Q9DBU3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Riok3Q9DBU3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Riok3Q9DBU3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Riok3Q9DBU3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Riok3Q9DBU3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Riok3Q9DBU3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Riok3Q9DBU3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Riok3Q9DBU3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Riok3Q9DBU3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Riok3Q9DBU3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Riok3Q9DBU3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Riok3Q9DBU3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.6 ms