Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc97Q9DBT3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc97Q9DBT3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc97Q9DBT3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc97Q9DBT3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc97Q9DBT3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc97Q9DBT3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc97Q9DBT3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc97Q9DBT3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc97Q9DBT3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc97Q9DBT3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc97Q9DBT3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc97Q9DBT3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc97Q9DBT3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc97Q9DBT3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc97Q9DBT3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc97Q9DBT3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc97Q9DBT3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc97Q9DBT3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc97Q9DBT3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc97Q9DBT3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc97Q9DBT3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc97Q9DBT3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc97Q9DBT3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc97Q9DBT3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc97Q9DBT3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc97Q9DBT3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc97Q9DBT3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc97Q9DBT3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc97Q9DBT3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc97Q9DBT3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc97Q9DBT3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc97Q9DBT3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc97Q9DBT3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc97Q9DBT3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc97Q9DBT3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc97Q9DBT3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc97Q9DBT3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc97Q9DBT3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc97Q9DBT3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc97Q9DBT3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc97Q9DBT3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc97Q9DBT3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc97Q9DBT3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc97Q9DBT3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc97Q9DBT3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc97Q9DBT3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc97Q9DBT3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc97Q9DBT3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc97Q9DBT3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc97Q9DBT3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc97Q9DBT3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc97Q9DBT3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc97Q9DBT3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc97Q9DBT3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc97Q9DBT3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc97Q9DBT3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc97Q9DBT3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc97Q9DBT3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc97Q9DBT3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc97Q9DBT3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc97Q9DBT3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc97Q9DBT3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc97Q9DBT3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc97Q9DBT3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc97Q9DBT3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc97Q9DBT3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc97Q9DBT3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc97Q9DBT3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc97Q9DBT3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc97Q9DBT3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc97Q9DBT3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc97Q9DBT3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc97Q9DBT3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc97Q9DBT3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc97Q9DBT3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc97Q9DBT3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc97Q9DBT3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc97Q9DBT3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc97Q9DBT3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc97Q9DBT3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc97Q9DBT3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc97Q9DBT3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc97Q9DBT3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc97Q9DBT3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc97Q9DBT3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc97Q9DBT3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc97Q9DBT3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc97Q9DBT3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms