Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB98

Leng1, Leukocyte receptor cluster member 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Leng1Q9DB98 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Leng1Q9DB98 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Leng1Q9DB98 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Leng1Q9DB98 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Leng1Q9DB98 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Leng1Q9DB98 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Leng1Q9DB98 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Leng1Q9DB98 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Leng1Q9DB98 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Leng1Q9DB98 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Leng1Q9DB98 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Leng1Q9DB98 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Leng1Q9DB98 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Leng1Q9DB98 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Leng1Q9DB98 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Leng1Q9DB98 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Leng1Q9DB98 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Leng1Q9DB98 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Leng1Q9DB98 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Leng1Q9DB98 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Leng1Q9DB98 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Leng1Q9DB98 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Leng1Q9DB98 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Leng1Q9DB98 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Leng1Q9DB98 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Leng1Q9DB98 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Leng1Q9DB98 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Leng1Q9DB98 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Leng1Q9DB98 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Leng1Q9DB98 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Leng1Q9DB98 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Leng1Q9DB98 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Leng1Q9DB98 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Leng1Q9DB98 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Leng1Q9DB98 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Leng1Q9DB98 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Leng1Q9DB98 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Leng1Q9DB98 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Leng1Q9DB98 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Leng1Q9DB98 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Leng1Q9DB98 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Leng1Q9DB98 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Leng1Q9DB98 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Leng1Q9DB98 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Leng1Q9DB98 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Leng1Q9DB98 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Leng1Q9DB98 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Leng1Q9DB98 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Leng1Q9DB98 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Leng1Q9DB98 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Leng1Q9DB98 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Leng1Q9DB98 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Leng1Q9DB98 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Leng1Q9DB98 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Leng1Q9DB98 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Leng1Q9DB98 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Leng1Q9DB98 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Leng1Q9DB98 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Leng1Q9DB98 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Leng1Q9DB98 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Leng1Q9DB98 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Leng1Q9DB98 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Leng1Q9DB98 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Leng1Q9DB98 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Leng1Q9DB98 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Leng1Q9DB98 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Leng1Q9DB98 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Leng1Q9DB98 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Leng1Q9DB98 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Leng1Q9DB98 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Leng1Q9DB98 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Leng1Q9DB98 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Leng1Q9DB98 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Leng1Q9DB98 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Leng1Q9DB98 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Leng1Q9DB98 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Leng1Q9DB98 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Leng1Q9DB98 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Leng1Q9DB98 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Leng1Q9DB98 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Leng1Q9DB98 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Leng1Q9DB98 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Leng1Q9DB98 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Leng1Q9DB98 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Leng1Q9DB98 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Leng1Q9DB98 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Leng1Q9DB98 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Leng1Q9DB98 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Leng1Q9DB98 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Leng1Q9DB98 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Leng1Q9DB98 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Leng1Q9DB98 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Leng1Q9DB98 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Leng1Q9DB98 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Leng1Q9DB98 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Leng1Q9DB98 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Leng1Q9DB98 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Leng1Q9DB98 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Leng1Q9DB98 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Leng1Q9DB98 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms