Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cmtm2aQ9DAR1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cmtm2aQ9DAR1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cmtm2aQ9DAR1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cmtm2aQ9DAR1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cmtm2aQ9DAR1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cmtm2aQ9DAR1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cmtm2aQ9DAR1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cmtm2aQ9DAR1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cmtm2aQ9DAR1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cmtm2aQ9DAR1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cmtm2aQ9DAR1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cmtm2aQ9DAR1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cmtm2aQ9DAR1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cmtm2aQ9DAR1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cmtm2aQ9DAR1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cmtm2aQ9DAR1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cmtm2aQ9DAR1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmtm2aQ9DAR1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmtm2aQ9DAR1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm2aQ9DAR1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm2aQ9DAR1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm2aQ9DAR1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmtm2aQ9DAR1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmtm2aQ9DAR1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmtm2aQ9DAR1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmtm2aQ9DAR1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmtm2aQ9DAR1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmtm2aQ9DAR1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmtm2aQ9DAR1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmtm2aQ9DAR1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmtm2aQ9DAR1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmtm2aQ9DAR1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmtm2aQ9DAR1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmtm2aQ9DAR1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm2aQ9DAR1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm2aQ9DAR1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm2aQ9DAR1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm2aQ9DAR1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm2aQ9DAR1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm2aQ9DAR1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm2aQ9DAR1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm2aQ9DAR1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cmtm2aQ9DAR1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cmtm2aQ9DAR1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtm2aQ9DAR1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm2aQ9DAR1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm2aQ9DAR1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm2aQ9DAR1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm2aQ9DAR1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm2aQ9DAR1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm2aQ9DAR1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm2aQ9DAR1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm2aQ9DAR1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm2aQ9DAR1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtm2aQ9DAR1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtm2aQ9DAR1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtm2aQ9DAR1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm2aQ9DAR1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm2aQ9DAR1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm2aQ9DAR1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm2aQ9DAR1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm2aQ9DAR1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm2aQ9DAR1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm2aQ9DAR1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm2aQ9DAR1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm2aQ9DAR1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm2aQ9DAR1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm2aQ9DAR1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm2aQ9DAR1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm2aQ9DAR1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm2aQ9DAR1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm2aQ9DAR1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm2aQ9DAR1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm2aQ9DAR1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm2aQ9DAR1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm2aQ9DAR1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm2aQ9DAR1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm2aQ9DAR1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm2aQ9DAR1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm2aQ9DAR1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmtm2aQ9DAR1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmtm2aQ9DAR1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmtm2aQ9DAR1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmtm2aQ9DAR1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmtm2aQ9DAR1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmtm2aQ9DAR1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmtm2aQ9DAR1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmtm2aQ9DAR1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmtm2aQ9DAR1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmtm2aQ9DAR1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmtm2aQ9DAR1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmtm2aQ9DAR1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmtm2aQ9DAR1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmtm2aQ9DAR1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmtm2aQ9DAR1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmtm2aQ9DAR1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmtm2aQ9DAR1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms