Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Calr3Q9D9Q6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Calr3Q9D9Q6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Calr3Q9D9Q6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Calr3Q9D9Q6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Calr3Q9D9Q6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Calr3Q9D9Q6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Calr3Q9D9Q6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Calr3Q9D9Q6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Calr3Q9D9Q6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Calr3Q9D9Q6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calr3Q9D9Q6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calr3Q9D9Q6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Calr3Q9D9Q6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calr3Q9D9Q6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Calr3Q9D9Q6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Calr3Q9D9Q6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Calr3Q9D9Q6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Calr3Q9D9Q6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Calr3Q9D9Q6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Calr3Q9D9Q6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Calr3Q9D9Q6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Calr3Q9D9Q6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Calr3Q9D9Q6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Calr3Q9D9Q6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Calr3Q9D9Q6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Calr3Q9D9Q6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Calr3Q9D9Q6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Calr3Q9D9Q6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calr3Q9D9Q6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calr3Q9D9Q6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calr3Q9D9Q6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calr3Q9D9Q6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calr3Q9D9Q6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calr3Q9D9Q6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calr3Q9D9Q6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calr3Q9D9Q6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calr3Q9D9Q6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Calr3Q9D9Q6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Calr3Q9D9Q6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Calr3Q9D9Q6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Calr3Q9D9Q6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Calr3Q9D9Q6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calr3Q9D9Q6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calr3Q9D9Q6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calr3Q9D9Q6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calr3Q9D9Q6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calr3Q9D9Q6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calr3Q9D9Q6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Calr3Q9D9Q6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calr3Q9D9Q6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calr3Q9D9Q6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calr3Q9D9Q6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calr3Q9D9Q6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Calr3Q9D9Q6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calr3Q9D9Q6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calr3Q9D9Q6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calr3Q9D9Q6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calr3Q9D9Q6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calr3Q9D9Q6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calr3Q9D9Q6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calr3Q9D9Q6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calr3Q9D9Q6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calr3Q9D9Q6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calr3Q9D9Q6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calr3Q9D9Q6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calr3Q9D9Q6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calr3Q9D9Q6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calr3Q9D9Q6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Calr3Q9D9Q6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Calr3Q9D9Q6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Calr3Q9D9Q6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Calr3Q9D9Q6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Calr3Q9D9Q6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Calr3Q9D9Q6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Calr3Q9D9Q6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calr3Q9D9Q6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calr3Q9D9Q6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calr3Q9D9Q6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calr3Q9D9Q6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calr3Q9D9Q6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calr3Q9D9Q6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Calr3Q9D9Q6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Calr3Q9D9Q6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calr3Q9D9Q6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calr3Q9D9Q6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calr3Q9D9Q6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calr3Q9D9Q6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Calr3Q9D9Q6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Calr3Q9D9Q6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Calr3Q9D9Q6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Calr3Q9D9Q6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calr3Q9D9Q6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calr3Q9D9Q6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calr3Q9D9Q6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Calr3Q9D9Q6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Calr3Q9D9Q6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Calr3Q9D9Q6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Calr3Q9D9Q6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calr3Q9D9Q6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms