Protein–RNA interactions for Protein: Q9D920

Borcs5, BLOC-1-related complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs5Q9D920 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Borcs5Q9D920 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Borcs5Q9D920 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Borcs5Q9D920 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Borcs5Q9D920 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Borcs5Q9D920 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Borcs5Q9D920 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Borcs5Q9D920 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Borcs5Q9D920 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Borcs5Q9D920 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Borcs5Q9D920 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Borcs5Q9D920 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Borcs5Q9D920 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Borcs5Q9D920 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Borcs5Q9D920 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Borcs5Q9D920 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Borcs5Q9D920 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Borcs5Q9D920 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Borcs5Q9D920 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Borcs5Q9D920 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Borcs5Q9D920 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Borcs5Q9D920 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Borcs5Q9D920 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Borcs5Q9D920 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Borcs5Q9D920 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Borcs5Q9D920 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Borcs5Q9D920 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Borcs5Q9D920 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Borcs5Q9D920 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Borcs5Q9D920 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Borcs5Q9D920 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Borcs5Q9D920 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Borcs5Q9D920 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Borcs5Q9D920 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Borcs5Q9D920 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Borcs5Q9D920 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Borcs5Q9D920 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Borcs5Q9D920 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Borcs5Q9D920 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Borcs5Q9D920 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Borcs5Q9D920 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Borcs5Q9D920 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Borcs5Q9D920 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Borcs5Q9D920 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Borcs5Q9D920 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Borcs5Q9D920 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Borcs5Q9D920 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Borcs5Q9D920 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Borcs5Q9D920 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Borcs5Q9D920 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Borcs5Q9D920 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Borcs5Q9D920 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Borcs5Q9D920 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Borcs5Q9D920 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Borcs5Q9D920 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Borcs5Q9D920 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Borcs5Q9D920 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Borcs5Q9D920 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Borcs5Q9D920 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Borcs5Q9D920 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Borcs5Q9D920 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Borcs5Q9D920 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Borcs5Q9D920 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Borcs5Q9D920 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Borcs5Q9D920 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Borcs5Q9D920 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Borcs5Q9D920 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Borcs5Q9D920 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Borcs5Q9D920 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Borcs5Q9D920 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Borcs5Q9D920 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Borcs5Q9D920 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Borcs5Q9D920 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Borcs5Q9D920 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Borcs5Q9D920 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Borcs5Q9D920 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Borcs5Q9D920 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Borcs5Q9D920 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Borcs5Q9D920 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Borcs5Q9D920 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Borcs5Q9D920 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Borcs5Q9D920 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Borcs5Q9D920 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Borcs5Q9D920 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Borcs5Q9D920 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Borcs5Q9D920 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Borcs5Q9D920 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Borcs5Q9D920 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Borcs5Q9D920 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Borcs5Q9D920 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Borcs5Q9D920 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Borcs5Q9D920 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Borcs5Q9D920 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Borcs5Q9D920 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Borcs5Q9D920 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Borcs5Q9D920 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Borcs5Q9D920 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Borcs5Q9D920 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Borcs5Q9D920 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Borcs5Q9D920 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms