Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2e2Q9D902 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2e2Q9D902 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2e2Q9D902 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2e2Q9D902 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2e2Q9D902 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2e2Q9D902 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2e2Q9D902 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2e2Q9D902 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2e2Q9D902 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2e2Q9D902 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2e2Q9D902 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2e2Q9D902 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2e2Q9D902 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2e2Q9D902 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2e2Q9D902 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2e2Q9D902 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2e2Q9D902 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2e2Q9D902 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2e2Q9D902 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2e2Q9D902 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2e2Q9D902 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2e2Q9D902 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2e2Q9D902 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2e2Q9D902 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2e2Q9D902 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2e2Q9D902 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2e2Q9D902 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2e2Q9D902 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2e2Q9D902 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2e2Q9D902 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2e2Q9D902 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2e2Q9D902 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e2Q9D902 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2e2Q9D902 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2e2Q9D902 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2e2Q9D902 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2e2Q9D902 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2e2Q9D902 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2e2Q9D902 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2e2Q9D902 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2e2Q9D902 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2e2Q9D902 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2e2Q9D902 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2e2Q9D902 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2e2Q9D902 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2e2Q9D902 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2e2Q9D902 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2e2Q9D902 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2e2Q9D902 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2e2Q9D902 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2e2Q9D902 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2e2Q9D902 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtf2e2Q9D902 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2e2Q9D902 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2e2Q9D902 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2e2Q9D902 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2e2Q9D902 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2e2Q9D902 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2e2Q9D902 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2e2Q9D902 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e2Q9D902 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e2Q9D902 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e2Q9D902 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2e2Q9D902 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2e2Q9D902 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2e2Q9D902 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2e2Q9D902 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2e2Q9D902 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2e2Q9D902 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2e2Q9D902 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2e2Q9D902 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2e2Q9D902 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2e2Q9D902 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2e2Q9D902 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2e2Q9D902 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2e2Q9D902 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2e2Q9D902 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2e2Q9D902 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2e2Q9D902 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2e2Q9D902 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2e2Q9D902 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2e2Q9D902 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2e2Q9D902 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2e2Q9D902 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2e2Q9D902 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e2Q9D902 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e2Q9D902 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e2Q9D902 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e2Q9D902 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e2Q9D902 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2e2Q9D902 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2e2Q9D902 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2e2Q9D902 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2e2Q9D902 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2e2Q9D902 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2e2Q9D902 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2e2Q9D902 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2e2Q9D902 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2e2Q9D902 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms