Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D8Q6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D8Q6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D8Q6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D8Q6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D8Q6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D8Q6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9D8Q6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D8Q6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D8Q6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D8Q6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D8Q6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D8Q6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D8Q6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D8Q6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D8Q6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D8Q6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D8Q6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D8Q6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D8Q6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D8Q6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D8Q6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D8Q6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D8Q6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D8Q6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D8Q6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D8Q6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D8Q6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D8Q6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D8Q6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D8Q6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D8Q6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D8Q6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D8Q6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D8Q6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D8Q6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D8Q6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D8Q6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D8Q6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D8Q6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D8Q6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D8Q6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D8Q6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D8Q6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D8Q6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q9D8Q6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q9D8Q6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D8Q6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D8Q6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D8Q6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D8Q6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D8Q6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D8Q6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D8Q6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D8Q6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D8Q6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D8Q6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D8Q6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D8Q6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D8Q6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D8Q6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D8Q6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D8Q6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D8Q6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D8Q6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D8Q6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D8Q6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D8Q6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D8Q6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D8Q6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D8Q6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D8Q6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D8Q6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D8Q6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D8Q6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D8Q6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9D8Q6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D8Q6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D8Q6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D8Q6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D8Q6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D8Q6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D8Q6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D8Q6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D8Q6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D8Q6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D8Q6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D8Q6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D8Q6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D8Q6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D8Q6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D8Q6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D8Q6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D8Q6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D8Q6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D8Q6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D8Q6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D8Q6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D8Q6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D8Q6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms