Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan13Q9D8C2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan13Q9D8C2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan13Q9D8C2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan13Q9D8C2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan13Q9D8C2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan13Q9D8C2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan13Q9D8C2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspan13Q9D8C2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan13Q9D8C2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan13Q9D8C2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan13Q9D8C2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan13Q9D8C2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspan13Q9D8C2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspan13Q9D8C2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan13Q9D8C2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan13Q9D8C2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan13Q9D8C2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan13Q9D8C2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan13Q9D8C2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan13Q9D8C2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan13Q9D8C2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan13Q9D8C2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan13Q9D8C2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan13Q9D8C2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan13Q9D8C2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan13Q9D8C2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan13Q9D8C2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan13Q9D8C2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan13Q9D8C2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan13Q9D8C2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan13Q9D8C2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan13Q9D8C2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan13Q9D8C2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan13Q9D8C2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan13Q9D8C2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan13Q9D8C2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan13Q9D8C2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tspan13Q9D8C2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan13Q9D8C2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan13Q9D8C2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan13Q9D8C2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan13Q9D8C2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan13Q9D8C2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan13Q9D8C2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan13Q9D8C2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan13Q9D8C2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan13Q9D8C2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan13Q9D8C2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan13Q9D8C2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan13Q9D8C2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan13Q9D8C2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan13Q9D8C2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan13Q9D8C2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan13Q9D8C2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan13Q9D8C2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan13Q9D8C2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan13Q9D8C2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan13Q9D8C2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.3 ms