Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7P7

Clic3, Chloride intracellular channel protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic3Q9D7P7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Clic3Q9D7P7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clic3Q9D7P7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clic3Q9D7P7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clic3Q9D7P7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clic3Q9D7P7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clic3Q9D7P7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clic3Q9D7P7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clic3Q9D7P7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clic3Q9D7P7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clic3Q9D7P7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clic3Q9D7P7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clic3Q9D7P7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clic3Q9D7P7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clic3Q9D7P7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clic3Q9D7P7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Clic3Q9D7P7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clic3Q9D7P7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clic3Q9D7P7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clic3Q9D7P7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clic3Q9D7P7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clic3Q9D7P7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clic3Q9D7P7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clic3Q9D7P7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clic3Q9D7P7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clic3Q9D7P7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Clic3Q9D7P7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clic3Q9D7P7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clic3Q9D7P7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clic3Q9D7P7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clic3Q9D7P7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clic3Q9D7P7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clic3Q9D7P7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clic3Q9D7P7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clic3Q9D7P7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clic3Q9D7P7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clic3Q9D7P7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clic3Q9D7P7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clic3Q9D7P7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clic3Q9D7P7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clic3Q9D7P7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clic3Q9D7P7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clic3Q9D7P7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clic3Q9D7P7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clic3Q9D7P7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clic3Q9D7P7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clic3Q9D7P7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clic3Q9D7P7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Clic3Q9D7P7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clic3Q9D7P7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clic3Q9D7P7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clic3Q9D7P7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clic3Q9D7P7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clic3Q9D7P7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clic3Q9D7P7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clic3Q9D7P7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clic3Q9D7P7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Clic3Q9D7P7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clic3Q9D7P7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clic3Q9D7P7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clic3Q9D7P7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clic3Q9D7P7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clic3Q9D7P7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clic3Q9D7P7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clic3Q9D7P7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clic3Q9D7P7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clic3Q9D7P7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clic3Q9D7P7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clic3Q9D7P7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clic3Q9D7P7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clic3Q9D7P7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clic3Q9D7P7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clic3Q9D7P7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clic3Q9D7P7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clic3Q9D7P7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clic3Q9D7P7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms