Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6K8

Fundc2, FUN14 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc2Q9D6K8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fundc2Q9D6K8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fundc2Q9D6K8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fundc2Q9D6K8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fundc2Q9D6K8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fundc2Q9D6K8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fundc2Q9D6K8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fundc2Q9D6K8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fundc2Q9D6K8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fundc2Q9D6K8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fundc2Q9D6K8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fundc2Q9D6K8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fundc2Q9D6K8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fundc2Q9D6K8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fundc2Q9D6K8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fundc2Q9D6K8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fundc2Q9D6K8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fundc2Q9D6K8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fundc2Q9D6K8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fundc2Q9D6K8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fundc2Q9D6K8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fundc2Q9D6K8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fundc2Q9D6K8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fundc2Q9D6K8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fundc2Q9D6K8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fundc2Q9D6K8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fundc2Q9D6K8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fundc2Q9D6K8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fundc2Q9D6K8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fundc2Q9D6K8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fundc2Q9D6K8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fundc2Q9D6K8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fundc2Q9D6K8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fundc2Q9D6K8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fundc2Q9D6K8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fundc2Q9D6K8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fundc2Q9D6K8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fundc2Q9D6K8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fundc2Q9D6K8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fundc2Q9D6K8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fundc2Q9D6K8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fundc2Q9D6K8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fundc2Q9D6K8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fundc2Q9D6K8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fundc2Q9D6K8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fundc2Q9D6K8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fundc2Q9D6K8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fundc2Q9D6K8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fundc2Q9D6K8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fundc2Q9D6K8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fundc2Q9D6K8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fundc2Q9D6K8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fundc2Q9D6K8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fundc2Q9D6K8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fundc2Q9D6K8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fundc2Q9D6K8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fundc2Q9D6K8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fundc2Q9D6K8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fundc2Q9D6K8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fundc2Q9D6K8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fundc2Q9D6K8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fundc2Q9D6K8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fundc2Q9D6K8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fundc2Q9D6K8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fundc2Q9D6K8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fundc2Q9D6K8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fundc2Q9D6K8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fundc2Q9D6K8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fundc2Q9D6K8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fundc2Q9D6K8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fundc2Q9D6K8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fundc2Q9D6K8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fundc2Q9D6K8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fundc2Q9D6K8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fundc2Q9D6K8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fundc2Q9D6K8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fundc2Q9D6K8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fundc2Q9D6K8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fundc2Q9D6K8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fundc2Q9D6K8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fundc2Q9D6K8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fundc2Q9D6K8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fundc2Q9D6K8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fundc2Q9D6K8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fundc2Q9D6K8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fundc2Q9D6K8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fundc2Q9D6K8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fundc2Q9D6K8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fundc2Q9D6K8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fundc2Q9D6K8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fundc2Q9D6K8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fundc2Q9D6K8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fundc2Q9D6K8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fundc2Q9D6K8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fundc2Q9D6K8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fundc2Q9D6K8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fundc2Q9D6K8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fundc2Q9D6K8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fundc2Q9D6K8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fundc2Q9D6K8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms