Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc94Q9D6J3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc94Q9D6J3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc94Q9D6J3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc94Q9D6J3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc94Q9D6J3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc94Q9D6J3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc94Q9D6J3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc94Q9D6J3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc94Q9D6J3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc94Q9D6J3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc94Q9D6J3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc94Q9D6J3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc94Q9D6J3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc94Q9D6J3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc94Q9D6J3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc94Q9D6J3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc94Q9D6J3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc94Q9D6J3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc94Q9D6J3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc94Q9D6J3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc94Q9D6J3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc94Q9D6J3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc94Q9D6J3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc94Q9D6J3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc94Q9D6J3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc94Q9D6J3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc94Q9D6J3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc94Q9D6J3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc94Q9D6J3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc94Q9D6J3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc94Q9D6J3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc94Q9D6J3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc94Q9D6J3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc94Q9D6J3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc94Q9D6J3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc94Q9D6J3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc94Q9D6J3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc94Q9D6J3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc94Q9D6J3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc94Q9D6J3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc94Q9D6J3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc94Q9D6J3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc94Q9D6J3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc94Q9D6J3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc94Q9D6J3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc94Q9D6J3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc94Q9D6J3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc94Q9D6J3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc94Q9D6J3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc94Q9D6J3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc94Q9D6J3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc94Q9D6J3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc94Q9D6J3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc94Q9D6J3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc94Q9D6J3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc94Q9D6J3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc94Q9D6J3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc94Q9D6J3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc94Q9D6J3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc94Q9D6J3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc94Q9D6J3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc94Q9D6J3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc94Q9D6J3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc94Q9D6J3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc94Q9D6J3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc94Q9D6J3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc94Q9D6J3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc94Q9D6J3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc94Q9D6J3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc94Q9D6J3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc94Q9D6J3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc94Q9D6J3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc94Q9D6J3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc94Q9D6J3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc94Q9D6J3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc94Q9D6J3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc94Q9D6J3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc94Q9D6J3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc94Q9D6J3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc94Q9D6J3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc94Q9D6J3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc94Q9D6J3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc94Q9D6J3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc94Q9D6J3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc94Q9D6J3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc94Q9D6J3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc94Q9D6J3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc94Q9D6J3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc94Q9D6J3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc94Q9D6J3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc94Q9D6J3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc94Q9D6J3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc94Q9D6J3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc94Q9D6J3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc94Q9D6J3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc94Q9D6J3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc94Q9D6J3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms