Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4G9

Rmi1, RecQ-mediated genome instability protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi1Q9D4G9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rmi1Q9D4G9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rmi1Q9D4G9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rmi1Q9D4G9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rmi1Q9D4G9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rmi1Q9D4G9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rmi1Q9D4G9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rmi1Q9D4G9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rmi1Q9D4G9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rmi1Q9D4G9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rmi1Q9D4G9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rmi1Q9D4G9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rmi1Q9D4G9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rmi1Q9D4G9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rmi1Q9D4G9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rmi1Q9D4G9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rmi1Q9D4G9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rmi1Q9D4G9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rmi1Q9D4G9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rmi1Q9D4G9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rmi1Q9D4G9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rmi1Q9D4G9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rmi1Q9D4G9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rmi1Q9D4G9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rmi1Q9D4G9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rmi1Q9D4G9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rmi1Q9D4G9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rmi1Q9D4G9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Rmi1Q9D4G9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rmi1Q9D4G9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rmi1Q9D4G9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rmi1Q9D4G9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rmi1Q9D4G9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rmi1Q9D4G9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rmi1Q9D4G9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rmi1Q9D4G9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rmi1Q9D4G9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rmi1Q9D4G9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rmi1Q9D4G9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rmi1Q9D4G9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rmi1Q9D4G9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rmi1Q9D4G9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rmi1Q9D4G9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rmi1Q9D4G9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rmi1Q9D4G9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rmi1Q9D4G9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rmi1Q9D4G9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rmi1Q9D4G9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rmi1Q9D4G9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rmi1Q9D4G9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rmi1Q9D4G9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rmi1Q9D4G9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rmi1Q9D4G9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rmi1Q9D4G9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rmi1Q9D4G9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rmi1Q9D4G9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rmi1Q9D4G9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rmi1Q9D4G9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rmi1Q9D4G9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rmi1Q9D4G9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rmi1Q9D4G9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rmi1Q9D4G9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rmi1Q9D4G9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rmi1Q9D4G9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rmi1Q9D4G9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rmi1Q9D4G9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rmi1Q9D4G9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rmi1Q9D4G9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rmi1Q9D4G9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rmi1Q9D4G9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rmi1Q9D4G9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rmi1Q9D4G9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rmi1Q9D4G9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rmi1Q9D4G9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rmi1Q9D4G9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rmi1Q9D4G9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rmi1Q9D4G9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rmi1Q9D4G9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rmi1Q9D4G9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rmi1Q9D4G9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rmi1Q9D4G9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rmi1Q9D4G9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rmi1Q9D4G9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rmi1Q9D4G9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rmi1Q9D4G9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rmi1Q9D4G9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rmi1Q9D4G9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rmi1Q9D4G9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rmi1Q9D4G9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rmi1Q9D4G9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rmi1Q9D4G9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rmi1Q9D4G9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rmi1Q9D4G9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rmi1Q9D4G9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rmi1Q9D4G9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rmi1Q9D4G9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rmi1Q9D4G9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rmi1Q9D4G9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rmi1Q9D4G9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rmi1Q9D4G9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms