Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B2

Ttc25, Tetratricopeptide repeat protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc25Q9D4B2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc25Q9D4B2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc25Q9D4B2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc25Q9D4B2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc25Q9D4B2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc25Q9D4B2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc25Q9D4B2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc25Q9D4B2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc25Q9D4B2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc25Q9D4B2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc25Q9D4B2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc25Q9D4B2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc25Q9D4B2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc25Q9D4B2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc25Q9D4B2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc25Q9D4B2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc25Q9D4B2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc25Q9D4B2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc25Q9D4B2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc25Q9D4B2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc25Q9D4B2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc25Q9D4B2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc25Q9D4B2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc25Q9D4B2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc25Q9D4B2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc25Q9D4B2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc25Q9D4B2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc25Q9D4B2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc25Q9D4B2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc25Q9D4B2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc25Q9D4B2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc25Q9D4B2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc25Q9D4B2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc25Q9D4B2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc25Q9D4B2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc25Q9D4B2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc25Q9D4B2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc25Q9D4B2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc25Q9D4B2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc25Q9D4B2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc25Q9D4B2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc25Q9D4B2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc25Q9D4B2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc25Q9D4B2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc25Q9D4B2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc25Q9D4B2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc25Q9D4B2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc25Q9D4B2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc25Q9D4B2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc25Q9D4B2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc25Q9D4B2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc25Q9D4B2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc25Q9D4B2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc25Q9D4B2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc25Q9D4B2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc25Q9D4B2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc25Q9D4B2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc25Q9D4B2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc25Q9D4B2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc25Q9D4B2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc25Q9D4B2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc25Q9D4B2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc25Q9D4B2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc25Q9D4B2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc25Q9D4B2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc25Q9D4B2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc25Q9D4B2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc25Q9D4B2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc25Q9D4B2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc25Q9D4B2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc25Q9D4B2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc25Q9D4B2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc25Q9D4B2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc25Q9D4B2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc25Q9D4B2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc25Q9D4B2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc25Q9D4B2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc25Q9D4B2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc25Q9D4B2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc25Q9D4B2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc25Q9D4B2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc25Q9D4B2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc25Q9D4B2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc25Q9D4B2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc25Q9D4B2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc25Q9D4B2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc25Q9D4B2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc25Q9D4B2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc25Q9D4B2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc25Q9D4B2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc25Q9D4B2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc25Q9D4B2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc25Q9D4B2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc25Q9D4B2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc25Q9D4B2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc25Q9D4B2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc25Q9D4B2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc25Q9D4B2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc25Q9D4B2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc25Q9D4B2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms