Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
5430402E10RikQ9D3N5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
5430402E10RikQ9D3N5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
5430402E10RikQ9D3N5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
5430402E10RikQ9D3N5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
5430402E10RikQ9D3N5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
5430402E10RikQ9D3N5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
5430402E10RikQ9D3N5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
5430402E10RikQ9D3N5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
5430402E10RikQ9D3N5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
5430402E10RikQ9D3N5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
5430402E10RikQ9D3N5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
5430402E10RikQ9D3N5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
5430402E10RikQ9D3N5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
5430402E10RikQ9D3N5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
5430402E10RikQ9D3N5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
5430402E10RikQ9D3N5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
5430402E10RikQ9D3N5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
5430402E10RikQ9D3N5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
5430402E10RikQ9D3N5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
5430402E10RikQ9D3N5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
5430402E10RikQ9D3N5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
5430402E10RikQ9D3N5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
5430402E10RikQ9D3N5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
5430402E10RikQ9D3N5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
5430402E10RikQ9D3N5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
5430402E10RikQ9D3N5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
5430402E10RikQ9D3N5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
5430402E10RikQ9D3N5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
5430402E10RikQ9D3N5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
5430402E10RikQ9D3N5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
5430402E10RikQ9D3N5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
5430402E10RikQ9D3N5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
5430402E10RikQ9D3N5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
5430402E10RikQ9D3N5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
5430402E10RikQ9D3N5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
5430402E10RikQ9D3N5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
5430402E10RikQ9D3N5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
5430402E10RikQ9D3N5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
5430402E10RikQ9D3N5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
5430402E10RikQ9D3N5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
5430402E10RikQ9D3N5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
5430402E10RikQ9D3N5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
5430402E10RikQ9D3N5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
5430402E10RikQ9D3N5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
5430402E10RikQ9D3N5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
5430402E10RikQ9D3N5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
5430402E10RikQ9D3N5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
5430402E10RikQ9D3N5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
5430402E10RikQ9D3N5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
5430402E10RikQ9D3N5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
5430402E10RikQ9D3N5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
5430402E10RikQ9D3N5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
5430402E10RikQ9D3N5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
5430402E10RikQ9D3N5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
5430402E10RikQ9D3N5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
5430402E10RikQ9D3N5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
5430402E10RikQ9D3N5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
5430402E10RikQ9D3N5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
5430402E10RikQ9D3N5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
5430402E10RikQ9D3N5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
5430402E10RikQ9D3N5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
5430402E10RikQ9D3N5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
5430402E10RikQ9D3N5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
5430402E10RikQ9D3N5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
5430402E10RikQ9D3N5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
5430402E10RikQ9D3N5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
5430402E10RikQ9D3N5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.29■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
5430402E10RikQ9D3N5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
5430402E10RikQ9D3N5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
5430402E10RikQ9D3N5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
5430402E10RikQ9D3N5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
5430402E10RikQ9D3N5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
5430402E10RikQ9D3N5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms