Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tspan11Q9D1D1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tspan11Q9D1D1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tspan11Q9D1D1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tspan11Q9D1D1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tspan11Q9D1D1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tspan11Q9D1D1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tspan11Q9D1D1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tspan11Q9D1D1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tspan11Q9D1D1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tspan11Q9D1D1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tspan11Q9D1D1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tspan11Q9D1D1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tspan11Q9D1D1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tspan11Q9D1D1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tspan11Q9D1D1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tspan11Q9D1D1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tspan11Q9D1D1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tspan11Q9D1D1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tspan11Q9D1D1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tspan11Q9D1D1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tspan11Q9D1D1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tspan11Q9D1D1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tspan11Q9D1D1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tspan11Q9D1D1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tspan11Q9D1D1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tspan11Q9D1D1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tspan11Q9D1D1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tspan11Q9D1D1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tspan11Q9D1D1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tspan11Q9D1D1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tspan11Q9D1D1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tspan11Q9D1D1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tspan11Q9D1D1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tspan11Q9D1D1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tspan11Q9D1D1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tspan11Q9D1D1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tspan11Q9D1D1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tspan11Q9D1D1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tspan11Q9D1D1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tspan11Q9D1D1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tspan11Q9D1D1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tspan11Q9D1D1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tspan11Q9D1D1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tspan11Q9D1D1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tspan11Q9D1D1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tspan11Q9D1D1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tspan11Q9D1D1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tspan11Q9D1D1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tspan11Q9D1D1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tspan11Q9D1D1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tspan11Q9D1D1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tspan11Q9D1D1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tspan11Q9D1D1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tspan11Q9D1D1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tspan11Q9D1D1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tspan11Q9D1D1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tspan11Q9D1D1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tspan11Q9D1D1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tspan11Q9D1D1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tspan11Q9D1D1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tspan11Q9D1D1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tspan11Q9D1D1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tspan11Q9D1D1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tspan11Q9D1D1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tspan11Q9D1D1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tspan11Q9D1D1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tspan11Q9D1D1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tspan11Q9D1D1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tspan11Q9D1D1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tspan11Q9D1D1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tspan11Q9D1D1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tspan11Q9D1D1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tspan11Q9D1D1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tspan11Q9D1D1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tspan11Q9D1D1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tspan11Q9D1D1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tspan11Q9D1D1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tspan11Q9D1D1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tspan11Q9D1D1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tspan11Q9D1D1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tspan11Q9D1D1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tspan11Q9D1D1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tspan11Q9D1D1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tspan11Q9D1D1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tspan11Q9D1D1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tspan11Q9D1D1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tspan11Q9D1D1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tspan11Q9D1D1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tspan11Q9D1D1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tspan11Q9D1D1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tspan11Q9D1D1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tspan11Q9D1D1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tspan11Q9D1D1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tspan11Q9D1D1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tspan11Q9D1D1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tspan11Q9D1D1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tspan11Q9D1D1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tspan11Q9D1D1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tspan11Q9D1D1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms