Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem88Q9D0N8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem88Q9D0N8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem88Q9D0N8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem88Q9D0N8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem88Q9D0N8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem88Q9D0N8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem88Q9D0N8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem88Q9D0N8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem88Q9D0N8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem88Q9D0N8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem88Q9D0N8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem88Q9D0N8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem88Q9D0N8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem88Q9D0N8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem88Q9D0N8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem88Q9D0N8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem88Q9D0N8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem88Q9D0N8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem88Q9D0N8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem88Q9D0N8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem88Q9D0N8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem88Q9D0N8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem88Q9D0N8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem88Q9D0N8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem88Q9D0N8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem88Q9D0N8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem88Q9D0N8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem88Q9D0N8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem88Q9D0N8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem88Q9D0N8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem88Q9D0N8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem88Q9D0N8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem88Q9D0N8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem88Q9D0N8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem88Q9D0N8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem88Q9D0N8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem88Q9D0N8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem88Q9D0N8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem88Q9D0N8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem88Q9D0N8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem88Q9D0N8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem88Q9D0N8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem88Q9D0N8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem88Q9D0N8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem88Q9D0N8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem88Q9D0N8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem88Q9D0N8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem88Q9D0N8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem88Q9D0N8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem88Q9D0N8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem88Q9D0N8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem88Q9D0N8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem88Q9D0N8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem88Q9D0N8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem88Q9D0N8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem88Q9D0N8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem88Q9D0N8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem88Q9D0N8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem88Q9D0N8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem88Q9D0N8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem88Q9D0N8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem88Q9D0N8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem88Q9D0N8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem88Q9D0N8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem88Q9D0N8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem88Q9D0N8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem88Q9D0N8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem88Q9D0N8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem88Q9D0N8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem88Q9D0N8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem88Q9D0N8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem88Q9D0N8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem88Q9D0N8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem88Q9D0N8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem88Q9D0N8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem88Q9D0N8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem88Q9D0N8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem88Q9D0N8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem88Q9D0N8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem88Q9D0N8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem88Q9D0N8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem88Q9D0N8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem88Q9D0N8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem88Q9D0N8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem88Q9D0N8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmem88Q9D0N8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem88Q9D0N8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem88Q9D0N8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem88Q9D0N8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem88Q9D0N8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem88Q9D0N8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem88Q9D0N8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem88Q9D0N8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem88Q9D0N8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem88Q9D0N8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem88Q9D0N8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem88Q9D0N8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem88Q9D0N8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem88Q9D0N8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms