Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Zbed3Q9D0L1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Zbed3Q9D0L1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Zbed3Q9D0L1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Zbed3Q9D0L1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Zbed3Q9D0L1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Zbed3Q9D0L1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Zbed3Q9D0L1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Zbed3Q9D0L1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Zbed3Q9D0L1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Zbed3Q9D0L1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Zbed3Q9D0L1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Zbed3Q9D0L1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Zbed3Q9D0L1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Zbed3Q9D0L1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Zbed3Q9D0L1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Zbed3Q9D0L1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Zbed3Q9D0L1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Zbed3Q9D0L1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Zbed3Q9D0L1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Zbed3Q9D0L1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Zbed3Q9D0L1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Zbed3Q9D0L1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Zbed3Q9D0L1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Zbed3Q9D0L1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Zbed3Q9D0L1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zbed3Q9D0L1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Zbed3Q9D0L1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Zbed3Q9D0L1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zbed3Q9D0L1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zbed3Q9D0L1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zbed3Q9D0L1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zbed3Q9D0L1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zbed3Q9D0L1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zbed3Q9D0L1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Zbed3Q9D0L1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Zbed3Q9D0L1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Zbed3Q9D0L1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Zbed3Q9D0L1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Zbed3Q9D0L1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Zbed3Q9D0L1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zbed3Q9D0L1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zbed3Q9D0L1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zbed3Q9D0L1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zbed3Q9D0L1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Zbed3Q9D0L1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Zbed3Q9D0L1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Zbed3Q9D0L1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zbed3Q9D0L1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zbed3Q9D0L1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zbed3Q9D0L1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zbed3Q9D0L1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zbed3Q9D0L1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zbed3Q9D0L1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zbed3Q9D0L1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Zbed3Q9D0L1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Zbed3Q9D0L1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Zbed3Q9D0L1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Zbed3Q9D0L1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zbed3Q9D0L1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zbed3Q9D0L1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zbed3Q9D0L1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zbed3Q9D0L1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zbed3Q9D0L1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zbed3Q9D0L1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zbed3Q9D0L1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zbed3Q9D0L1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zbed3Q9D0L1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zbed3Q9D0L1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Zbed3Q9D0L1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Zbed3Q9D0L1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Zbed3Q9D0L1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zbed3Q9D0L1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zbed3Q9D0L1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zbed3Q9D0L1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Zbed3Q9D0L1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Zbed3Q9D0L1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Zbed3Q9D0L1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zbed3Q9D0L1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Zbed3Q9D0L1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Zbed3Q9D0L1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Zbed3Q9D0L1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zbed3Q9D0L1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zbed3Q9D0L1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zbed3Q9D0L1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zbed3Q9D0L1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zbed3Q9D0L1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zbed3Q9D0L1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zbed3Q9D0L1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Zbed3Q9D0L1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zbed3Q9D0L1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zbed3Q9D0L1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zbed3Q9D0L1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zbed3Q9D0L1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Zbed3Q9D0L1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Zbed3Q9D0L1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Zbed3Q9D0L1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.2 ms