Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930535I16RikQ9CUI2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930535I16RikQ9CUI2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
4930535I16RikQ9CUI2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930535I16RikQ9CUI2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930535I16RikQ9CUI2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930535I16RikQ9CUI2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms