Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRZ8

Tspo2, Translocator protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspo2Q9CRZ8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspo2Q9CRZ8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspo2Q9CRZ8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspo2Q9CRZ8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspo2Q9CRZ8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspo2Q9CRZ8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspo2Q9CRZ8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspo2Q9CRZ8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspo2Q9CRZ8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspo2Q9CRZ8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspo2Q9CRZ8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspo2Q9CRZ8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspo2Q9CRZ8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspo2Q9CRZ8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspo2Q9CRZ8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspo2Q9CRZ8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspo2Q9CRZ8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tspo2Q9CRZ8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspo2Q9CRZ8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspo2Q9CRZ8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tspo2Q9CRZ8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspo2Q9CRZ8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspo2Q9CRZ8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspo2Q9CRZ8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspo2Q9CRZ8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspo2Q9CRZ8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspo2Q9CRZ8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspo2Q9CRZ8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspo2Q9CRZ8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspo2Q9CRZ8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspo2Q9CRZ8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspo2Q9CRZ8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspo2Q9CRZ8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspo2Q9CRZ8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspo2Q9CRZ8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspo2Q9CRZ8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspo2Q9CRZ8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspo2Q9CRZ8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspo2Q9CRZ8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspo2Q9CRZ8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspo2Q9CRZ8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspo2Q9CRZ8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspo2Q9CRZ8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspo2Q9CRZ8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspo2Q9CRZ8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspo2Q9CRZ8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspo2Q9CRZ8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspo2Q9CRZ8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspo2Q9CRZ8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspo2Q9CRZ8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspo2Q9CRZ8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspo2Q9CRZ8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspo2Q9CRZ8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspo2Q9CRZ8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspo2Q9CRZ8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspo2Q9CRZ8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspo2Q9CRZ8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspo2Q9CRZ8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspo2Q9CRZ8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspo2Q9CRZ8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspo2Q9CRZ8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspo2Q9CRZ8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspo2Q9CRZ8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspo2Q9CRZ8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspo2Q9CRZ8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspo2Q9CRZ8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspo2Q9CRZ8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspo2Q9CRZ8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspo2Q9CRZ8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspo2Q9CRZ8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspo2Q9CRZ8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspo2Q9CRZ8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspo2Q9CRZ8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspo2Q9CRZ8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspo2Q9CRZ8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspo2Q9CRZ8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspo2Q9CRZ8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspo2Q9CRZ8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspo2Q9CRZ8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspo2Q9CRZ8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspo2Q9CRZ8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspo2Q9CRZ8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspo2Q9CRZ8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspo2Q9CRZ8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspo2Q9CRZ8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspo2Q9CRZ8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspo2Q9CRZ8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspo2Q9CRZ8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspo2Q9CRZ8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspo2Q9CRZ8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspo2Q9CRZ8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspo2Q9CRZ8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspo2Q9CRZ8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspo2Q9CRZ8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspo2Q9CRZ8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspo2Q9CRZ8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspo2Q9CRZ8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspo2Q9CRZ8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspo2Q9CRZ8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspo2Q9CRZ8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms