Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR25

Dph2, 2-(3-amino-3-carboxypropyl)histidine synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph2Q9CR25 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dph2Q9CR25 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dph2Q9CR25 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dph2Q9CR25 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dph2Q9CR25 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dph2Q9CR25 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dph2Q9CR25 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Dph2Q9CR25 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dph2Q9CR25 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dph2Q9CR25 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dph2Q9CR25 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dph2Q9CR25 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dph2Q9CR25 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dph2Q9CR25 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dph2Q9CR25 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dph2Q9CR25 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dph2Q9CR25 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dph2Q9CR25 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dph2Q9CR25 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dph2Q9CR25 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dph2Q9CR25 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dph2Q9CR25 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dph2Q9CR25 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Dph2Q9CR25 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dph2Q9CR25 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dph2Q9CR25 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dph2Q9CR25 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dph2Q9CR25 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dph2Q9CR25 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dph2Q9CR25 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dph2Q9CR25 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dph2Q9CR25 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dph2Q9CR25 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dph2Q9CR25 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dph2Q9CR25 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dph2Q9CR25 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dph2Q9CR25 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dph2Q9CR25 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dph2Q9CR25 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dph2Q9CR25 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dph2Q9CR25 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dph2Q9CR25 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dph2Q9CR25 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dph2Q9CR25 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dph2Q9CR25 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dph2Q9CR25 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dph2Q9CR25 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Dph2Q9CR25 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dph2Q9CR25 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dph2Q9CR25 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dph2Q9CR25 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dph2Q9CR25 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Dph2Q9CR25 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dph2Q9CR25 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dph2Q9CR25 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dph2Q9CR25 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dph2Q9CR25 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dph2Q9CR25 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dph2Q9CR25 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dph2Q9CR25 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dph2Q9CR25 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dph2Q9CR25 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dph2Q9CR25 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dph2Q9CR25 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dph2Q9CR25 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dph2Q9CR25 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dph2Q9CR25 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dph2Q9CR25 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dph2Q9CR25 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dph2Q9CR25 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dph2Q9CR25 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dph2Q9CR25 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dph2Q9CR25 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dph2Q9CR25 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Dph2Q9CR25 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dph2Q9CR25 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dph2Q9CR25 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dph2Q9CR25 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dph2Q9CR25 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dph2Q9CR25 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dph2Q9CR25 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dph2Q9CR25 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dph2Q9CR25 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dph2Q9CR25 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dph2Q9CR25 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dph2Q9CR25 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dph2Q9CR25 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dph2Q9CR25 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Dph2Q9CR25 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dph2Q9CR25 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dph2Q9CR25 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dph2Q9CR25 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dph2Q9CR25 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Dph2Q9CR25 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dph2Q9CR25 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Dph2Q9CR25 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dph2Q9CR25 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dph2Q9CR25 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dph2Q9CR25 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dph2Q9CR25 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms