Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chchd5Q9CQP3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chchd5Q9CQP3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chchd5Q9CQP3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chchd5Q9CQP3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chchd5Q9CQP3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chchd5Q9CQP3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chchd5Q9CQP3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chchd5Q9CQP3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Chchd5Q9CQP3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chchd5Q9CQP3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Chchd5Q9CQP3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chchd5Q9CQP3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chchd5Q9CQP3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chchd5Q9CQP3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chchd5Q9CQP3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chchd5Q9CQP3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chchd5Q9CQP3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chchd5Q9CQP3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chchd5Q9CQP3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Chchd5Q9CQP3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chchd5Q9CQP3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chchd5Q9CQP3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chchd5Q9CQP3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Chchd5Q9CQP3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chchd5Q9CQP3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chchd5Q9CQP3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chchd5Q9CQP3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chchd5Q9CQP3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chchd5Q9CQP3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chchd5Q9CQP3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chchd5Q9CQP3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chchd5Q9CQP3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chchd5Q9CQP3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Chchd5Q9CQP3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chchd5Q9CQP3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Chchd5Q9CQP3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chchd5Q9CQP3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chchd5Q9CQP3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chchd5Q9CQP3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chchd5Q9CQP3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chchd5Q9CQP3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chchd5Q9CQP3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chchd5Q9CQP3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chchd5Q9CQP3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chchd5Q9CQP3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chchd5Q9CQP3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chchd5Q9CQP3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chchd5Q9CQP3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chchd5Q9CQP3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chchd5Q9CQP3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chchd5Q9CQP3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chchd5Q9CQP3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chchd5Q9CQP3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chchd5Q9CQP3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chchd5Q9CQP3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chchd5Q9CQP3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chchd5Q9CQP3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chchd5Q9CQP3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chchd5Q9CQP3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chchd5Q9CQP3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chchd5Q9CQP3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chchd5Q9CQP3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chchd5Q9CQP3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd5Q9CQP3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd5Q9CQP3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chchd5Q9CQP3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chchd5Q9CQP3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chchd5Q9CQP3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chchd5Q9CQP3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chchd5Q9CQP3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chchd5Q9CQP3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chchd5Q9CQP3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chchd5Q9CQP3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chchd5Q9CQP3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chchd5Q9CQP3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chchd5Q9CQP3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chchd5Q9CQP3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chchd5Q9CQP3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chchd5Q9CQP3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chchd5Q9CQP3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chchd5Q9CQP3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chchd5Q9CQP3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chchd5Q9CQP3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chchd5Q9CQP3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Chchd5Q9CQP3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chchd5Q9CQP3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chchd5Q9CQP3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chchd5Q9CQP3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chchd5Q9CQP3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chchd5Q9CQP3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chchd5Q9CQP3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chchd5Q9CQP3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chchd5Q9CQP3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chchd5Q9CQP3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chchd5Q9CQP3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chchd5Q9CQP3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Chchd5Q9CQP3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chchd5Q9CQP3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chchd5Q9CQP3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms