Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN3

Tomm6, Mitochondrial import receptor subunit TOM6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm6Q9CQN3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tomm6Q9CQN3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tomm6Q9CQN3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tomm6Q9CQN3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tomm6Q9CQN3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tomm6Q9CQN3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tomm6Q9CQN3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tomm6Q9CQN3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tomm6Q9CQN3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tomm6Q9CQN3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tomm6Q9CQN3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tomm6Q9CQN3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tomm6Q9CQN3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tomm6Q9CQN3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tomm6Q9CQN3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tomm6Q9CQN3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tomm6Q9CQN3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tomm6Q9CQN3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tomm6Q9CQN3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tomm6Q9CQN3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tomm6Q9CQN3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tomm6Q9CQN3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tomm6Q9CQN3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tomm6Q9CQN3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tomm6Q9CQN3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tomm6Q9CQN3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tomm6Q9CQN3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tomm6Q9CQN3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tomm6Q9CQN3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tomm6Q9CQN3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tomm6Q9CQN3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tomm6Q9CQN3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tomm6Q9CQN3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tomm6Q9CQN3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tomm6Q9CQN3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tomm6Q9CQN3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tomm6Q9CQN3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tomm6Q9CQN3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tomm6Q9CQN3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tomm6Q9CQN3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tomm6Q9CQN3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tomm6Q9CQN3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tomm6Q9CQN3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tomm6Q9CQN3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tomm6Q9CQN3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tomm6Q9CQN3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tomm6Q9CQN3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tomm6Q9CQN3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tomm6Q9CQN3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tomm6Q9CQN3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tomm6Q9CQN3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tomm6Q9CQN3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tomm6Q9CQN3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tomm6Q9CQN3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tomm6Q9CQN3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tomm6Q9CQN3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tomm6Q9CQN3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tomm6Q9CQN3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tomm6Q9CQN3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tomm6Q9CQN3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tomm6Q9CQN3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tomm6Q9CQN3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tomm6Q9CQN3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tomm6Q9CQN3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tomm6Q9CQN3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tomm6Q9CQN3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tomm6Q9CQN3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tomm6Q9CQN3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tomm6Q9CQN3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tomm6Q9CQN3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tomm6Q9CQN3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tomm6Q9CQN3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tomm6Q9CQN3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tomm6Q9CQN3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tomm6Q9CQN3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tomm6Q9CQN3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tomm6Q9CQN3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tomm6Q9CQN3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tomm6Q9CQN3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tomm6Q9CQN3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tomm6Q9CQN3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tomm6Q9CQN3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tomm6Q9CQN3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tomm6Q9CQN3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tomm6Q9CQN3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tomm6Q9CQN3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tomm6Q9CQN3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tomm6Q9CQN3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tomm6Q9CQN3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tomm6Q9CQN3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tomm6Q9CQN3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tomm6Q9CQN3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tomm6Q9CQN3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tomm6Q9CQN3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tomm6Q9CQN3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tomm6Q9CQN3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tomm6Q9CQN3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tomm6Q9CQN3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tomm6Q9CQN3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tomm6Q9CQN3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms