Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Higd2aQ9CQJ1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Higd2aQ9CQJ1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Higd2aQ9CQJ1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Higd2aQ9CQJ1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Higd2aQ9CQJ1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Higd2aQ9CQJ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Higd2aQ9CQJ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Higd2aQ9CQJ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Higd2aQ9CQJ1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Higd2aQ9CQJ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Higd2aQ9CQJ1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Higd2aQ9CQJ1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Higd2aQ9CQJ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Higd2aQ9CQJ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Higd2aQ9CQJ1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Higd2aQ9CQJ1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Higd2aQ9CQJ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Higd2aQ9CQJ1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Higd2aQ9CQJ1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Higd2aQ9CQJ1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Higd2aQ9CQJ1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Higd2aQ9CQJ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Higd2aQ9CQJ1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Higd2aQ9CQJ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Higd2aQ9CQJ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Higd2aQ9CQJ1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Higd2aQ9CQJ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Higd2aQ9CQJ1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Higd2aQ9CQJ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Higd2aQ9CQJ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Higd2aQ9CQJ1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Higd2aQ9CQJ1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Higd2aQ9CQJ1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Higd2aQ9CQJ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Higd2aQ9CQJ1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Higd2aQ9CQJ1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Higd2aQ9CQJ1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Higd2aQ9CQJ1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Higd2aQ9CQJ1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Higd2aQ9CQJ1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Higd2aQ9CQJ1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Higd2aQ9CQJ1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Higd2aQ9CQJ1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Higd2aQ9CQJ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Higd2aQ9CQJ1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Higd2aQ9CQJ1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Higd2aQ9CQJ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Higd2aQ9CQJ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Higd2aQ9CQJ1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd2aQ9CQJ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd2aQ9CQJ1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Higd2aQ9CQJ1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Higd2aQ9CQJ1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Higd2aQ9CQJ1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Higd2aQ9CQJ1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Higd2aQ9CQJ1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Higd2aQ9CQJ1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Higd2aQ9CQJ1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Higd2aQ9CQJ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Higd2aQ9CQJ1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Higd2aQ9CQJ1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Higd2aQ9CQJ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Higd2aQ9CQJ1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Higd2aQ9CQJ1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Higd2aQ9CQJ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Higd2aQ9CQJ1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Higd2aQ9CQJ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Higd2aQ9CQJ1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Higd2aQ9CQJ1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Higd2aQ9CQJ1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Higd2aQ9CQJ1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Higd2aQ9CQJ1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Higd2aQ9CQJ1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Higd2aQ9CQJ1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.9 ms